科研产出
侵染稀硷的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征
《微生物学报 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：从云南红河稀硷上分离到病毒分离物Y6 4 ,全序列测定表明 ,Y6 4DNA_A全长 2 730个核苷酸。基因组比较发现 ,Y6 4DNA_A与中国番茄黄化曲叶病毒Y38分离物 (TYLCCNV_[Y38])同源性最高 (99% ) ,与中国番茄黄化曲叶病毒广西分离物 (TYLCCNV)的同源性次之 (96 % ) ,而与亚洲地区的其它双生病毒的同源性均在 83%以下 ,表明稀硷上的分离物Y6 4是TYLCCNV的 1个分离物。利用DNAβ的特异性引物beta0 1和beta0 2 ,在病毒分离物Y6 4中扩增到卫星DNA分子 (Y6 4 β)。序列分析表明 ,Y6 4 β全长 1 340个核苷酸 ,至少在其互补链上编码 1个有功能的ORF(C1 )。Y6 4 β的全序列与TYLCCNV的各个分离物的卫星分子 (Y38β、Y36 β和Y8β)的同源性最高 ,分别为 99 5 %、99 5 %和 99 3% ;与其它已报道的卫星DNAβ的同源性均低于 6 6 4 %。系统关系树研究表明 ,卫星DNAβ分子与其辅助病毒是共同进化的。
关键词： 中国番茄黄化曲叶病毒 稀硷 菜豆金色花叶病毒层 卫星DNAβ
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赛葵黄脉病毒:一种含有卫星DNA的双生病毒新种
《科学通报 》 2003 北大核心 CSCD
摘要：从云南红河地区表现黄脉症状的杂草——赛葵上分离到病毒分离物Y47.对Y47进行DNA-A的全序列测定,结果表明,Y47 DNA-A全长2731个核苷酸,基因组具有典型的双生病毒科病毒特征,即编码6个ORFs,其中病毒链编码AV1(CP)和AV2共2个ORFs,互补链编码ACl～4共4个ORFs.对基因组进一步比较发现,Y47 DNA-A与秋葵黄脉花叶病毒分离物201(GenBank登录号:AJ002451)的同源性最高,达77％,而与其他双生病毒的同源性均在76％以下,表明Y47是双生病毒的一个新种,命名为赛葵黄脉病毒(MYVV).利用DNAβ的特异性引物beta01和beta02,从Y47中扩增到卫星DNA分子(Y47β).序列分析表明,Y47β全长1348个核苷酸,至少在其互补链上编码一个有功能的ORF(Cl).Y47β的全序列与Multan棉花曲叶病毒和Rajasthan棉花曲叶病毒的DNAβ的核苷酸同源性最高,为62％～67％,而与其他已报道的DNAβ的同源性均低于46％.系统关系树分析表明,卫星DNAβ分子与其辅助病毒是共同进化的.
关键词： 赛葵黄脉病毒 赛葵 Begomovirus DNA-A DNAβ
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