小RNA深度测序鉴定昭通市烟草脉斑病病毒

陶永萍; 尹跃艳; 陈旭; 卢训; 李婷婷; 赵声春; 游堂贵; 丁铭; 《植物保护 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：烟草脉斑病在云南昭通市的烟草上发生危害严重,为明确昭通市烟草脉斑病的病毒种类,本研究采集昭通市的4个烟草种植区症状表现为疑似烟草脉斑病的烟草样品,采用小RNA深度测序技术对不同来源的混合样品进行小RNA测序分析。结果显示混合样品中的病毒分别属于烟草花叶病毒属Tobamovirus、马铃薯Y病毒属Potyvirus和马铃薯卷叶病毒属Polerovirus。根据不同病毒属设计通用引物,分别对不同地区的烟草样品进行RT-PCR验证,结果表明,烟草样品中病毒种类有烟草花叶病毒、烟草脉带花叶病毒、烟草脉扭病毒和马铃薯Y病毒的PVYN、PVYN-Wi和PVYNTN株系。

关键词： 烟草脉斑病 烟草病毒 小RNA深度测序

深度测序技术分析番茄斑萎病毒病害寄主及介体中病毒种类

尹跃艳; 李婷婷; 卢训; 丁铭; 《植物病理学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：正番茄斑萎病毒属病毒(orthotospoviruses)是严重危害云南蔬菜等重要农业经济作物的病毒病原之一。采用血清学检测、小RNA深度测序以及RT-PCR验证相结合的方法,从云南省昆明市晋宁区的主要作物寄主(番茄、辣椒、油麦菜)、重要中间寄主(鬼针草)和传毒介体(蓟马)中鉴定到TSWV、TZSV、PCSV和INSV 4种病毒,其中TSWV为该地区的主要优势病毒,而PCSV则是首次报道侵染鬼针草。通过对云南番茄斑萎病毒病害重病区作物寄主、中间寄主及蓟马三者进行病毒种类分析研究,明确TSWV为引起云南省昆明市晋宁区作物的主要病毒,TZSV、PCSV和INSV零星发生于不同寄主中。

关键词： 正番茄斑萎病毒属病毒 番茄斑萎病害 寄主 传播介体

云南番茄褪绿病毒和菜豆金色花叶病毒属病毒复合侵染番茄的分子鉴定

尹跃艳; 卢训; 李婷婷; 李凡; 兰梅; 丁铭; 《植物保护学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：菜豆金色花叶病毒属Begomovirus是双生病毒科Geminiviridae中病毒种类最多且最具经济毁灭性的病毒属(Martelli et al.,2011)。云南省楚雄州元谋县是我国重要反季节蔬菜种植基地,番茄是该县主要的反季节种植蔬菜,由于气候条件适宜,该地区番茄受菜豆金色花叶病毒属病毒危害严重。近年来

云南西瓜银灰斑驳病毒病害的鉴定

尹跃艳; 卢训; 李婷婷; 李红祥; 郭淼; 赵丽玲; 张晓云; 丁铭; 《植物病理学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：应用DAS-ELISA和RT-PCR方法从褪绿和银色斑驳的西瓜叶片中检测到病毒分离物(WSMoV-YN),感病样品能与WSMoV/GBNV复合抗血清(Agdia)呈阳性反应。获得WSMoV N蛋白的多克隆抗体,抗体能与WSMoV血清组成员CaCV和TZSV反应,但不能与INSV、TSWV、HCRV和GYSV反应。为明确引起该病害的病毒种类,采用Tospovirus通用引物对样品的总RNA进行RT-PCR扩增,获得长度为3 554 nt的S RNA全序列,经Blastn比对分析与WSMoV中国台湾分离物同源性最高,为95.8%,其N和NSs蛋白氨基酸序列同源性分别为99%和97.6%。构建系统进化树发现,西瓜银灰斑驳病毒云南分离物(WSMoV-YN)与其他WSMoV聚为一支。确定引起云南西瓜病害的病毒为WSMoV。

关键词： 西瓜 西瓜银灰斑驳病毒 S RNA 血清学特性