云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"

武晓阳; 杨亚洲; 隆文杰; 陈丹; 周国雁; 杜娟; 伍少云; 蔡青; 黄兴奇; 《安徽农业科学 》 2022

摘要：[目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系。[方法]比较四路糯与B73基因组中“124”转座子的构成差异。[结果]在B73基因组中鉴定出13个“124”转座子序列和其插入位点信息；通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列，并从中鉴定出17个“124”转座子序列和其插入位点信息；在二者基因组中存在3个共同的“124”插入位点，这些位点展示出“124”转座子在序列和插入位点一致；B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中“124”一致的转座子序列；建立的系统进化树可将“124”转座子归为4种类型，其中并没有单一基因组来源的类型。[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异。

关键词： 糯玉米地方品种 四路糯 重测序 “124”转座子 起源演化