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资源类型: 中文期刊
关键词:分子生物学检测(模糊匹配)
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滇池沉积物中厌氧氨氧化菌的分子生物学检测

西南农业学报 2016 北大核心 CSCD

摘要:厌氧氨氧化(Anaerobic ammonium oxidation,Anammox)在海洋氮素循环中起了重要作用,而有关天然淡水生态系统中厌氧氨氧化菌的研究报道并不多。为探索滇池沉积物中是否存在厌氧氨氧化菌及厌氧氨氧化菌的种类,以滇池沉积物总DNA为模板,PCR扩增沉积物样品中厌氧氨氧化菌特异性16S r DNA片段,通过构建克隆、测序,将文库中有效克隆序列分别提交到Gen Bank中进行相似序列搜索,并利用MEGA4.0绘制系统发育树。分析发现,滇池沉积物中存在厌氧氨氧化菌,且种群多样性水平低,低于目前已报道的大部分自然生态系统,所有克隆序列与已发现的厌氧氨氧化菌Candidatus Brocadia Fulgida的同源性达97%以上,表明滇池沉积物中的厌氧氨氧化菌以Brocadia属的Fulgida菌为主。

关键词: 滇池 沉积物 厌氧氨氧化菌 分子生物学检测

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