科研产出
侵染曼陀罗的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNAβ全基因组结构特征
《植物病理学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：从云南大理曼陀罗上采集到病毒分离物YN72,症状表现为叶脉增厚、叶片褪绿、植株矮化。全序列测定表明,YN72DNA-A全长2 739个核苷酸。基因组比较发现,YN72 DNA-A与中国番茄黄化曲叶病毒分离物(TYLCCNV-[Y43])同源性最高(93.4%),与中国番茄黄化曲叶病毒烟草分离物(TYLCCNV-[Y5])的同源性次之(92.9%),而与亚洲地区的其它双生病毒的同源性均在90%以下,表明曼陀罗中的分离物YN72是TYLCCNV的1个分离物。利用W TG s卫星分子DNAβ的特异性引物beta01和beta02,在YN72中PCR扩增到DNAβ分子。序列分析表明,YN72β全长1 335个核苷酸,在其互补链上编码1个有功能的ORF(C1)。YN72β的全序列与TYLCCNV分离物卫星分子Beanβ和Y297β的同源性最高,分别为99.8%和99.3%;与其它所比较的DNAβ的同源性均低于80.6%。系统进化树研究表明,YN72卫星分子DNAβ与其辅助病毒是共同进化的。
关键词： 中国番茄黄化曲叶病毒 曼陀罗 菜豆金色黄花叶病毒属 卫星DNAβ
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侵染稀硷的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征
《微生物学报 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：从云南红河稀硷上分离到病毒分离物Y6 4 ,全序列测定表明 ,Y6 4DNA_A全长 2 730个核苷酸。基因组比较发现 ,Y6 4DNA_A与中国番茄黄化曲叶病毒Y38分离物 (TYLCCNV_[Y38])同源性最高 (99% ) ,与中国番茄黄化曲叶病毒广西分离物 (TYLCCNV)的同源性次之 (96 % ) ,而与亚洲地区的其它双生病毒的同源性均在 83%以下 ,表明稀硷上的分离物Y6 4是TYLCCNV的 1个分离物。利用DNAβ的特异性引物beta0 1和beta0 2 ,在病毒分离物Y6 4中扩增到卫星DNA分子 (Y6 4 β)。序列分析表明 ,Y6 4 β全长 1 340个核苷酸 ,至少在其互补链上编码 1个有功能的ORF(C1 )。Y6 4 β的全序列与TYLCCNV的各个分离物的卫星分子 (Y38β、Y36 β和Y8β)的同源性最高 ,分别为 99 5 %、99 5 %和 99 3% ;与其它已报道的卫星DNAβ的同源性均低于 6 6 4 %。系统关系树研究表明 ,卫星DNAβ分子与其辅助病毒是共同进化的。
关键词： 中国番茄黄化曲叶病毒 稀硷 菜豆金色花叶病毒层 卫星DNAβ
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