利用SSR标记分析普通野生稻遗传多样性

董超; 张斐斐; 汤翠凤; 阿新祥; 甘树仙; 杨雅云; 刘自单; 戴陆园; 《广东农业科学 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：【目的】揭示中国云南景洪、云南元江、江西东乡、缅甸普通野生稻(Oryza rufipogen Griff.)遗传多样性，以及云南景洪和元江普通野生稻原、异位保存下变异情况。【方法】利用36对SSR标记对来自云南景洪异位保护与原位保护区、云南元江异位保护与原位保护区、江西东乡及缅甸共102份普通野生稻进行检测，开展不同地理来源及不同保存方式下普通野生稻居群遗传多样性比较与聚类分析。【结果】供试普通野生稻检测出等位变异(Na)110个，平均3.056个，变幅为1～5个；Nei's基因多样性指数(I)平均为0.448。不同地理来源Nei’s基因多样性指数大小为：缅甸(0.561)>云南景洪(0.437)>云南元江(0.236)>江西东乡(0.230)，云南景洪和元江的普通野生稻Nei’s基因多样性指数均表现为异位保护区大于原位保护区(云南景洪：0.498>0.131，云南元江：0.264>0.035)。聚类与遗传分化分析显示，供试材料平均遗传相似系数为0.772，变幅0.260～1.000；在遗传相似系数0.635处可将供试材料划分为云南景洪、云南元江、江西东乡及缅甸居群。云南景洪原位保护区与缅甸的普通野生稻遗传距离较近(0.560)，云南元江原位保护区与江西东乡的普通野生稻遗传距离较近(0.552)；而云南元江原位保护区与景洪原位保护区的普通野生稻遗传距离为0.748，表明云南元江和景洪普通野生稻有明显的遗传分化。【结论】不同地区的普通野生稻遗传分化有明显的地域性，云南景洪和元江普通野生稻遗传多样性因原生境居群减少而下降。

关键词： 普通野生稻 SSR标记 遗传多样性 居群 原位保护 异位保护 遗传分化