科研产出
云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"
《安徽农业科学 》 2022
摘要：[目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系。[方法]比较四路糯与B73基因组中“124”转座子的构成差异。[结果]在B73基因组中鉴定出13个“124”转座子序列和其插入位点信息；通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列，并从中鉴定出17个“124”转座子序列和其插入位点信息；在二者基因组中存在3个共同的“124”插入位点，这些位点展示出“124”转座子在序列和插入位点一致；B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中“124”一致的转座子序列；建立的系统进化树可将“124”转座子归为4种类型，其中并没有单一基因组来源的类型。[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异。
关键词： 糯玉米地方品种 四路糯 重测序 “124”转座子 起源演化
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云南不同来源四路糯玉米waxy和tb1基因分析
《安徽农业科学 》 2020
摘要：[目的]为四路糯资源的保护、研究与开发利用特异资源提供科学依据。[方法]对8份云南不同来源的四路糯资源材料进行糯性基因waxy、分蘖基因tb1的测序及SSR分子标记分析,探讨不同来源四路糯的形成规律。[结果]试验所用糯玉米具有共同的突变类型wx-D10,即waxy基因第10外显子15-bp的缺失;检测控制分蘖的tb1基因发现,在四路糯中保留了2类不同的等位基因,并发现具有杂合基因型的植株存在;进一步利用40对SSR标记检测不同来源的四路糯,获得了27个多态性基因位点。[结论]试验所用四路糯有统一的起源,在形成后基因组内依然保留了大量多等位基因位点,由于四路糯在传播过程中发生不同等位基因的丢失,形成不同类型的四路糯。
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