基于16SrDNA基因高通量测序分析植烟土壤的细菌群落结构

刘加红; 高华锋; 解燕; 马伟; 余磊; 孔垂思; 蔺忠龙; 杨涛; 《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：钾是影响烤烟品质的重要元素之一,为研究不同烤烟品质植烟区土壤的细菌群落,以期为提高烤烟品质提供依据,本研究通过对采取烤烟高钾植烟区的土样、烤烟低钾植烟区的土样,并通过宏基因组16SrDNA基因高通量测序,分析不同植烟区土壤细菌的群落结构,结果表明,高钾地区获得较多的有效序列。Shannon指数及Simpson指数共同表明高钾地区土样具有的细菌群落多样性最高。ACE指数与Chao1指数具有相同的趋势,都表明高钾地区土样具有的细菌群落丰富度最高。不同土壤样品细菌属水平的聚类分析显示把低钾地区的样品聚在一起,这些样品菌群分布比较相似。功能基因预测分析研究表明,高钾地区样品具有最多功能基因数量。

关键词： 土壤宏基因组 16SrDNA 植烟土壤 细菌 群落结构