科研产出
大麻类纤维素合酶基因家族生物信息学分析
《贵州农业科学 》 2025 北大核心
摘要：【目的】探明大麻类纤维素合酶（Cellulose synthase-like, Csl）基因家族成员的结构和功能，为调控大麻生长发育提供参考。【方法】通过生物信息学方法对大麻Csl家族成员的理化性质、系统进化、基因结构和保守基序及启动子顺式作用元件等进行分析。【结果】从大麻中共鉴定得到24个Csl家族成员，除7号染色体外其余9条染色体上均有成员分布，各成员外显子数目为3～9个。系统进化树分析显示，24个家族成员被分为CslA、CslB、CslC、CslD、CslE、CslG共6个亚族，其中CslC和CslD成员最多，均有6个。保守基序分析发现，Motif2和Motif3在6个亚族蛋白中均有分布，而Motif6、Motif8和Motif9仅在CslA和CslC亚族蛋白中分布，Motif1、Motif4、Motif7和Motif10仅在CslB、CslD、CslE和CslG亚族蛋白中分布。CsCsls基因启动子区域包含光响应、激素诱导元件、逆境响应元件和MYB结合位点。经公共转录组数据分析发现，除CsCslB2在叶中特异表达外，大部分成员在根和茎中表达水平明显高于叶片。不同亚族成员在茎秆不同组织和不同部位及下胚轴不同发育时期的表达量也存在一定差异。【结论】推测Csl家族基因除介导大麻纤维中半纤维素合成外，还参与大麻生长发育和逆境响应等其他生物学进程。
关键词： 大麻 半纤维素 类纤维素合酶 基因家族 生物信息学 逆境响应
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红腺忍冬绿原酸生物合成新基因克隆及其生物信息学分析
《中国中药杂志 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为挖掘红腺忍冬绿原酸生物合成的关键酶基因,应用生物信息学方法从红腺忍冬基因组数据库中筛选出4个新基因LHPAL4,LHHCT1,LHHCT2,LHHCT3,并预测其编码蛋白的结构和功能。序列分析结果表明,红腺忍冬LHPAL4与LHPAL1关系密切;LHHCT1,LHHCT3,LHHQT2关系密切,LHHCT2单独聚为一类。通过Real-time PCR检测4个新基因在红腺忍冬不同组织中的转录情况,发现LHPAL4,LHHCT1,LHHCT3在败花中表达量最高,LHHCT2在叶中的表达量最高,为揭示不同部位活性成分含量差异机制提供依据,也为活性成分的合成生物学提供元件。
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