露兜树感染黄瓜花叶病毒的鉴定

王凯利; 张洁; 吴阔; 杨学宝; 魏建丽; 王昌命; 董家红; 《园艺学报 》 2019 北大核心 CSCD

摘要：为了确定引起云南元江露兜树(Pandanus tectorius)叶片黄化、花叶斑点的病毒病原.取症状明显的叶片进行负染,经电镜观察到病毒粒子形态为球形,直径约为30 nm.使用黄瓜花叶病毒外壳蛋白基因序列特异性引物,对露兜树上的病毒分离物进行病毒基因RT-PCR扩增分析,克隆、测序目的片段,发现其与印度、中国四川、泰国的黄瓜花叶病毒分离物的外壳蛋白基因序列相似性为98%,属于CMV亚组Ⅰ.这是露兜树被病毒感染的首次报道.

关键词： 露兜树 黄瓜花叶病毒 病毒粒子 外壳蛋白基因 侵染

番木瓜环斑病毒南瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析

杨国慧; 张仲凯; 崔崇士; 《植物保护学报 》 2007 北大核心 CSCD

摘要：利用电镜和酶联免疫法在云南省采集到的5份南瓜病样中检测到番木瓜环斑病毒(Papayaring spot virus,PRSV)。为了进一步从分子水平确定云南省南瓜病毒病原种类,并为下一步转基因育种提供抗性基因,采用反转录PCR(RT-PCR)方法扩增了5个分离物的外壳蛋白(coat protein,CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,番木瓜环斑病毒石屏分离物(PRSV-SP)和番木瓜环斑病毒蒙自分离物(PRSV-MZ)的CP基因长873nt,编码290个氨基酸,番木瓜环斑病毒峨山分离物(PRSV-ES)、番木瓜环斑病毒版纳分离物(PRSV-BN)和番木瓜环斑病毒宾川分离物(PRSV-BC),3个分离物CP基因长867nt,编码288个氨基酸。PRSV5个分离物核苷酸序列的同源性在94%以上,氨基酸序列的同源性在96%以上。与国内外17个分离物相比,核苷酸序列同源性为89.6%~98.7%,氨基酸序列同源性为86.5%~99.6%。其中PRSV-SP和来自于越南分离物PRSV-V47无论是核苷酸序列,还是氨基酸序列同源性都达到了最高,而5个分离物与来自于巴西(PRSV-BR)、美国(PRSV-USA)、墨西哥(PRSV-Y)核苷酸序列同源性均低于90%。

关键词： 南瓜 番木瓜环斑病毒 外壳蛋白基因 序列分析

马铃薯A病毒云南分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析

丁铭; 方琦; 张丽珍; 李婷婷; 董家红; 张仲凯; 《西南农业学报 》 2006 CSCD

摘要：根据马铃薯病毒A(Potato virusA,PVA)外壳蛋白(CP)基因序列设计合成的一对引物,以带病毒植株总RNA为模板,RT-PCR扩增得到长约800 bp的目的片段。将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体并进行了序列测定,测得全长为807 bp的PVA CP基因。测序结果与PVA其他分离物CP基因序列比较,其氨基酸同源性最高可达98.5%。根据GenBank中PVA CP氨基酸序列建立了病毒的系统进化树并对PVA不同分离物CP氨基酸序列差异性进行了分析。

关键词： 马铃薯A病毒 云南分离物 外壳蛋白基因 序列分析

西瓜花叶病毒2号南瓜分离物的鉴定及其外壳蛋白基因序列分析

杨国慧; 张仲凯; 崔崇士; 《植物病理学报 》 2004 北大核心 CSCD

摘要：利用电镜和酶联免疫吸附测定法(ELISA)在黑龙江省采集的南瓜病样中检测到西瓜花叶病毒2号(WMV-2)。再利用免疫PCR(IC-PCR)和反转录PCR(RT-PCR)方法,扩增获得其外壳蛋白(CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,该分离物CP基因全长为852个核苷酸,编码由284个氨基酸组成的31.8 kDa蛋白。与国外已报道的WMV-2 CP基因相比,其核苷酸序列同源性为92.2％-94.O％,由此推导的氨基酸序列同源性为94.5％-98.1％。与国内2个分离物相比,和山西分离物核苷酸和氨基酸的同源性都达到98.5％,和郑州分离物核苷酸和氨基酸的同源性分别为91.5％和95.0％。

关键词： 南瓜 西瓜花叶病毒2号 鉴定 外壳蛋白基因

云南五个不同地区烟草花叶病毒外壳蛋白基因的序列比较

丁铭; 方琦; 张丽珍; 杨录明; 汪继玲; 李滟芳; 张仲凯; 《中国病毒学 》 2004 CSCD

关键词： 烟草花叶病毒 外壳蛋白基因 克隆 序列分析