科研产出
甘、芥种间杂交后代DH株系K0959 PEG干旱胁迫差异表达研究
《南方农业学报 》 2011 CSCD
摘要：【目的】了解甘、芥种间杂交后代抗旱材料K0959在干旱胁迫处理下相关基因的表达情况。【方法】利用cDNA-AFLP技术,以经25%PEG-6000胁迫处理的K0959植株叶片为材料,比较其与非胁迫处理对照的基因表达差异。【结果】从128个引物组合中筛选出16个引物组合,可获得30余条差异片段;经二次扩增,可获得15个大小为102～384bp、在胁迫中表达的差异片段。通过对片段的克隆测序、同源性比对,15个差异片段中,有7个片段与拟南芥的mRNA同源性较高,其中4个片段(2B,2D,3-2B和14B)为非重复的TDFs;1个片段(3D)与甘蓝的同源性较高,1个片段(2C)与甘蓝型油菜的mRNA同源性较高,而6个大小为102～240bp的片段(D2-1、6A和9-2C等)在GenBank中与已知基因或序列无任何同源性,可能为尚未发现的新基因。其中6个已知功能的TDFs片段分别参与能量、新陈代谢、细胞运输途径以及细胞周期和DNA加工等过程。【结论】获得的差异表达基因对于了解甘、芥种间杂交后代油菜抗旱性形成的调控机制具有参考价值。
关键词： 油菜 种间杂交 抗旱 差异表达 cDNA-AFLP
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甘蓝型油菜双主茎材料苗期抗旱相关基因的cDNA-AFLP差异显示
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：在云南本地芥菜型油菜文山大脚黄(母本)与甘蓝型油菜品种花油5号(父本)杂交F1小孢子培养获得的DH群体中分离出双主茎材料,其田间表现具有良好的抗旱性。利用cDNA-AFLP技术分析七叶期甘蓝型油菜双主茎材料在干旱和对照条件下基因差异表达情况。共筛选了512对引物组合,获得56个干旱诱导上调表达的差异片段。对36个大于100 bp的片段克隆测序、同源比对、结果归并为30个非重复的TDFs,对已知功能的18个TDFs功能预测表明这些片段参与了细胞形态建成与降解、代谢、能量、细胞周期、蛋白质合成、蛋白质修饰、蛋白质结合、运输途径等相关过程。本试验获得的差异表达基因对于了解油菜苗期抗旱性形成的调控机制具有一定的参考价值。
关键词： 甘蓝型油菜 双主茎 抗旱 差异表达 cDNA-AFLP
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差异表达研究方法及其在作物耐旱基因筛选中的应用
《西南农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：抑制性消减杂交(SSH)、cDNA微阵列技术,差异显示PCR(DD-PCR)、代表性差异分析(RDA)、表达序列标签(ESTs)、基因表达连续性分析(SAGE)、cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)几种技术是目前基因差异表达的主要研究方法。本文分析了各种方法的优缺点,综述了干旱胁迫下玉米、水稻、小麦基因差异表达的研究进展后认为,对干旱胁迫与正常浇水对照的基因差异表达研究,进而分离抗旱基因,是进行作物抗耐旱转基因、创造抗耐旱种质资源,进而选育抗耐旱作物新品种的基础。在基因差异表达研究中,以采用cDNA-AFLP技术为宜。
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月季突变体抑制差减杂交cDNA文库构建及分析
《园艺学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：为了分析月季花色花香突变机理和揭示花色花香代谢的相关基因,利用抑制性消减杂交技术分离了月季红花无香突变体‘往日情怀’(以下简称突变体)与其野生型金黄色浓香品系‘金银岛’(以下简称野生型)之间表达差异cDNA片段。分别以突变体作为驱赶子,野生型为检测子,以及以野生型作为驱赶子,突变体为检测子建立了两个差异表达cDNA文库WSSH和JSSH,分别代表在突变体和野生型中特异表达的cDNA;再经文库高密度点阵膜的杂交差示筛选分析,在WSSH库中获得特异表达的27个阳性克隆,在JSSH文库中得到25个阳性克隆。差异表达克隆测序后经BLAST比对分析发现WSSH文库中含有与红花突变体的花青素积累直接相关的CHS、DFR、细胞色素P450加单氧酶、乙二醛酶Ⅰ、己糖转移因子、MYB1转录因子、S-腺苷蛋氨酸转移酶、ADR等花色相关EST;JSSH文库中含有与野生型花香形成相关的月季甲基间苯二酚O-甲基转移酶、转醛醇酶、Acyl-CoA结合蛋白、钙调素结合蛋白、MYB92转录因子的EST以及导致芽变的Ty1-copia-like逆转座子。
关键词： 月季 抑制性消减杂交 花色 花香 突变体 差异表达
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