科研产出
斑籽木中番茄黄化曲叶病毒与伴随卫星的分子鉴定及基因组结构分析
《植物保护学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为明确番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl virus,TYLCV）对杂草斑籽木Baliospermum solanifolium的侵染情况，自云南省元谋县小丙岭村番茄地周边田间地头采集具有黄化、花叶症状的斑籽木病样和健康样品，对样品中病毒及伴随卫星进行PCR检测、全基因组克隆和测序、SDT比对分析、基因组结构特征分析和重组分析。结果显示：从2个斑籽木病样中共分离到4条菜豆金色花叶病毒属Begomovirus病毒DNA-A全序列和4条β卫星全序列；分离的4条DNA-A全基因组序列均与TYLCV中国分离物的核苷酸序列相似性最高，为100.0%；在分离的4条β卫星全序列中，2条β卫星分离物与赛葵黄脉β卫星（Malvastrum yellow vein betasatellite,MaYVB）分离物的核苷酸序列相似性最高，大于99.2%，另外2条β卫星分离物与中国番茄曲叶β卫星（tomato leaf curl China betasatellite,ToLCCNB）分离物的核苷酸序列相似性最高，大于94.6%；系统进化分析结果显示所获得的分离物均与云南省TYLCV分离物亲缘关系较近，获得的所有序列均未发现重组现象。表明TYLCV可伴随不同种的β卫星共同侵染斑籽木，斑籽木是一个易感TYLCV的中间寄主。
关键词： 番茄黄化曲叶病毒 斑籽木 β卫星 重组分析 序列比对 发育树
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抗根肿病大白菜材料SSR分子标记的初步筛选
《农学学报 》 2023
摘要：为了明确抗根肿病大白菜材料CCR12049中的抗病基因,进一步开发分子标记.以高抗根肿病的高代自交系大白菜CCR12049、高感根肿病的高代自交系大白菜CM12081、CCR12049和CM12081杂交得到的F1及F1自交构建的F2分离群体为试材,通过人工接种鉴定、聚丙烯酰胺凝胶电泳和序列比对.结果显示,该抗病材料中的根肿病抗性由显性单基因控制;36对引物在2个亲本和F1中初步筛选出4对有多态性的引物,在F2中进一步验证,发现只有1对(cr-26)在F2中的扩增结果与表型鉴定一致;2个亲本及F1的PCR产物测序比对发现,在95~111 bp这个位置,抗病亲本和F1的序列完全相同,但是感病材料在这个位置出现了17个碱基(TCTCTATCTCTTACGCA)的缺失.可以推断抗病材料可能是由于这17个碱基的插入从而表现出抗病性,该标记可以将抗感材料区分开,该标记可以作为一个初步筛选白菜抗根肿病的SSR分子标记来利用.
关键词： 大白菜 根肿病 SSR分子标记 遗传规律 序列比对
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