科研产出
11个单粒花生脂肪酸近红外定量分析模型构建
《中国油料作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：随机选取80份不同花生品种籽仁，依托德国布鲁克光谱仪器公司MPA型傅里叶变换红外光谱仪构建了单粒花生油酸、亚油酸、棕榈酸、芥酸近红外定量分析模型，并首次构建了单粒花生一烯酸、棕榈一烯酸、山嵛酸、豆蔻酸、α-亚麻酸及长链饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸近红外定量分析模型。经OPUS 7.5软件自动优化，花生籽仁油酸、亚油酸、棕榈酸、山嵛酸、豆蔻酸、长链饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸的最佳光谱预处理方式均为“一阶导数+矢量归一化”，维数分别为10、10、8、10、5、10、10，决定系数（R~2）分别为0.98、0.98、0.97、0.87、0.88、0.93、0.98，根均方差（RMSECV）分别为2.87%、2.18%、0.461%、0.133%、0.00416%、0.741%、0.19%；芥酸的最佳光谱预处理方式为“一阶导数+多元散射校正”，维数为9,R~2为0.92;RMSECV为0.00628%；棕榈一烯酸的最佳光谱预处理方式为“一阶导数+减去一条直线”，维数为10,R~2为0.80,RMSECV为0.00602%；花生一烯酸和α-亚麻酸的最佳光谱预处理方式均为“矢量归一化”，维数分别为8、10,R~2分别为0.88、0.77,RMSECV分别为0.0731%、0.026%。经检验各项指标真实值和模型预测值平均相对偏差在0.12%～2.50%之间。11个花生籽仁脂肪酸近红外定量分析模型预测效果较好，可用于花生遗传育种和加工中的品质快速筛选和鉴评。
关键词： 花生 近红外反射光谱技术 α-亚麻酸 油酸 亚油酸
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甘蓝型油菜BnFAD2基因的生物信息学分析
《湖北农业科学 》 2021 北大核心
摘要：以拟南芥（Arabidopsis thaliana）AtFAD2为参考序列,通过BLAST进行同源序列比对,获得FAD2基因在甘蓝（Brassica oleracea）、白菜（Brassica rapa）和甘蓝型油菜（Brassica napus）基因组中的同源拷贝。运用生物信息学方法分析其氨基酸序列的组成、蛋白质基本理化性质、亚细胞定位、亲水性和疏水性、蛋白质二三级结构、保守结构域,并对FAD2基因编辑靶点进行预测及sgRNA设计。在白菜、甘蓝与甘蓝型油菜获得2条FAD2基因同源蛋白质序列;亚细胞定位显示这些AtFAD2同源蛋白质均位于内质网,肽链表现为疏水性、比较稳定;蛋白质序列二三级结构预测表明,主要以α-螺旋和无规则卷曲为组成成分;蛋白质序列保守结构域分析显示,FAD2具有高度的序列保守性,属于Membrane-FADS-like超家族,且含PLN02505保守结构域;系统进化树构建分析显示,甘蓝型油菜和白菜、甘蓝以及芥菜型油菜具有紧密的亲缘关系;CRISPR-Cas9基因编辑靶点分析发现,甘蓝型油菜FAD2基因中存在10段高度保守性序列可作为候选靶点,并设计出相应的sgRNA。
关键词： 甘蓝型油菜 FAD2 生物信息学 sgRNA 油酸
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甘蓝型油菜Fad2基因的RNA干扰及无筛选标记高油酸含量转基因油菜新种质的获得
《植物生理与分子生物学学报 》 2006 北大核心 CSCD
摘要：利用已获得的油菜种子贮存蛋白——十字花科蛋白(cruciferin)基因的启动子和终止子,构建了无选择标记基因且同时具有正义及反义结构的油酰去饱和酶基因(Fad2)种子特异表达RNAi载体,并通过农杆菌介导的转化,获得了只含有油菜原有基因且Fad2基因表达受抑制的转基因植株。RT-PCR分析结果表明,在油酸含量达到83.9%的转基因植株中未检测到在非转基因植株中普遍存在的Fad2基因转录mRNA——一种典型的RNA干扰现象。通过对植株生长发育状态的观察比较,该高油酸含量转基因株系并未表现出双突变体中由于Fad2基因的失活所引起的植株抗寒能力差、发育迟缓、花蕾死亡、结实率低等不利农艺学性状。
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