烟酰胺类化合物与灰葡萄孢菌琥珀酸脱氢酶的分子对接研究

王凯博; 杨云海; 姜珊珊; 吴文伟; 何成兴; 吴永丽; 杨维剑; 《云南农业科技 》 2018

摘要：本研究以"同源建模"的方法预测灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)琥珀酸脱氢酶的结构,使用Auto-Dock分子对接软件研究烟酰胺类化合物与其可能的作用靶标琥珀酸脱氢酶之间的结合模式,并分析烟酰胺类化合物和靶标之间的亲和力与其抑菌活性之间的关系。结果表明,琥珀酸脱氢酶中部分氨基酸构成的活性口袋能够与烟酰胺类化合物结合,两者之间的亲和力与化合物的抑菌活性之间具有相关性。通过分子对接方法预测化合物与靶标的结合是对杀菌剂抑菌机制的基础探索,同时能够为杀菌剂先导化合物的设计提供指导。

关键词： 琥珀酸脱氢酶 同源建模 分子对接 烟酰胺