科研产出
云南石屏蔗区甘蔗白条病菌的分子鉴定
《甘蔗糖业 》 2023
摘要：为明确2023年在云南石屏蔗区发现的疑似甘蔗白条病症状蔗株病原,利用白条黄单胞菌[Xanthomonas albilineans(Ashby)Dowson]特异性引物XAF1/XAR1对32份疑似病样进行PCR分子鉴定.结果表明所有样品都扩增得到大小约578 bp的特异性条带,GenBank登陆号OR495793-OR495802.对所获序列进行同源性和系统进化分析,发现其与白条黄单胞菌Xa-FJ1菌株的三磷酸腺苷结合盒(Adenosine triphosphate-biding cassette,ABC)转运蛋白基因abc(GenBank登陆号:MH709206)的序列一致性为99.8%~100%,且在系统发育树中处于同一进化分支.结合田间症状诊断和分子鉴定结果,确认云南石屏蔗区发生的甘蔗病害为X.albilineans引起的甘蔗白条病,这是云南石屏蔗区首次发现.研究结果为今后甘蔗白条病的有效防控提供了科学依据.
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分光光度计法在甘蔗白条病致病菌菌液浓度测定上的应用
《中国糖料 》 2022
摘要：采用分光光度计法,建立快速准确测定白条黄单胞杆菌菌液浓度的方法.首先在4个波长下,以分光光度计测定的不同稀释浓度白条黄单胞杆菌菌悬液光密度值(OD值)为自变量x,以平板计数法获得的对应稀释浓度菌悬液细菌浓度为因变量y,分别建立二者间的标准曲线和线性回归方程;根据回归方程的决定系数(R2)最大化、均方根误差(RMSE)和相对均方根误差(NRMSE)最小化原则筛选出最适波长和最优线性回归方程,最终实现菌悬液浓度的快速估算.结果表明,在4个波长下,平板计数法测定的白条黄单胞杆菌菌液浓度(0.5×108~12.5×108 cfu/mL)与分光光度计测定的OD值(0.03~1.95)之间线性关系良好,其中在600 nm波长下建立的标准曲线线性回归方程y=11.263x+0.117为最优方程,决定系数R2为0.9967,绝对误差RMSE为0.26×108 cfu/mL,相对误差NRMSE为4.93%.通过进一步应用验证,该回归方程预测结果与平板计数结果无显著差异(P>0.05).研究结果可靠准确,可作为测定白条黄单胞杆菌菌液浓度的标准方法进行应用.
关键词： 甘蔗白条病 白条黄单胞杆菌 分光光度计法 平板计数法 线性相关
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云南甘蔗白条病的多基因联合鉴定
《植物保护 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：甘蔗白条病是由白条黄单胞菌Xanthomonas albilineans(Ashby) Dowson引起的甘蔗重要病害。2017年在云南保山、孟定和金平蔗区的甘蔗上发现疑似白条病的病害。从病株蔗茎中分离得到圆形,凸面,光滑,有光泽,黄色的细菌菌落。经柯赫氏法则验证,分离得到的细菌为该病害的病原菌。使用16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因对分离得到的病原菌进行了分子鉴定,BLAST和系统发育分析表明本研究所获得的病原菌的3个基因的核苷酸序列与白条黄单胞菌GPE PC73菌株(GenBank登录号:FP565176)对应基因的核苷酸序列一致性均为100%,在系统发育树中处于同一分支。根据田间症状诊断、柯赫氏法则验证及分子鉴定结果,确认云南保山、孟定和金平发生的甘蔗病害为X.albilineans引起的甘蔗白条病。
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广西蔗区检测发现检疫性病害甘蔗白条病
《中国农学通报 》 2018
摘要：为明确2016年在广西北海、来宾、百色蔗区发现的疑似甘蔗白条病症状蔗株致病病原。利用白条黄单胞菌特异性引物XAF1/XAR1对采自这3个蔗区的62份疑似病样进行PCR检测鉴定。鉴定结果表明:62份疑似病样都能够获得约600 bp的特异性片段,所得序列完全一致大小均为608 bp(Gen Bank登录号:KY315183--KY315203),其与白条黄单胞菌rax B1基因核苷酸序列(Gen Bank登录号:FP565176)一致性为100%,在系统进化树中处于同一分支。田间调查结果显示:甘蔗品种‘桂糖46号’、‘桂糖06-2081’对于白条黄单胞菌高度感病,病株率一般为18%~50%,严重田块高达100%;染病严重蔗株全叶枯萎,茎的节部长出许多侧芽,侧芽叶片具白色条纹,造成大幅度减产减糖。本研究在广西蔗区检测发现由白条黄单孢菌引起的检疫性病害甘蔗白条病。
关键词： 广西蔗区 甘蔗白条病 PCR检测 白条黄单胞菌 序列分析
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