基于小RNA测序技术和RT-PCR检测云南省大樱桃病毒

郭淼; 李婷婷; 王朝文; 钟静; 陈越; 和加卫; 丁铭; 《植物病理学报 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：我国是大樱桃的主要产区,目前种植面积位居世界首位,随着种植面积的不断扩大,病毒病严重制约了大樱桃生产.本研究对云南3个大樱桃主要繁育基地(陆良、宣威和丽江)的6个大樱桃品种的病毒病发生情况调查,发现主要症状为植株矮化、小叶、叶片皱缩、畸形、斑驳、叶片褐色斑点等症状,发病率在10%~30%之间.对每个品种混合样品进行小RNA测序,并利用RT-PCR对小RNA测序分析得到的病毒种类进行验证.结果表明,在陆良样品中检测到樱桃病毒A(cherry vi-rus A,CVA)、李属坏死环斑病毒(prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)、李树皮坏死与茎痘伴随病毒(plum bark necrosis stem pitting-associated virus,PBNSPaV)、柑橘叶斑病毒(citrus leaf blotch virus,CLBV)和樱桃小果病毒-1(little cherry virus-1,LChV-1);宣威样品中检测到CVA和PNRSV;丽江样品中检测到CVA、PNRSV、PBNSPaV、CLBV和樱桃小果病毒-2(lit-tle cherry virus-2,LChV-2).序列分析表明,这5种病毒分别与GenBank中登录注册的病毒核苷酸序列均具有较高的一致性.其中,PNRSV在不同种植区的品种中检出率较高,推测有可能是目前云南大樱桃种植区的主要病毒种类,其危害情况有待于进一步研究.

关键词： 云南 大樱桃 小RNA深度测序 病毒种类