科研产出
云南西部地区疣粒野生稻的调查、收集与保护
《农业科学研究 》 2025
摘要：疣粒野生稻（Oryza meyeriana）是珍稀濒危植物资源，云南是疣粒野生稻的起源地之一，而云南西部地区疣粒野生稻日前的自然分布状态及其生境情况尚不清楚。为了解该地区疣粒野生稻的生长现状和分布情况，以制订科学合理的野生稻资源保护措施，分别于2023年8月和11月对保山市、德宏州和临沧市等滇西地区的疣粒野生稻开展调查。2次共调查8个分布点，其中6个分布点面积不足31 m2，这些分布点占分布点总数的75%，说明该地区的疣粒野生稻已处于濒危状态。橡胶树、柚木、甘蔗等经济作物的扩大种植与道路扩建是造成疣粒野生稻原生境被破环的主要原因。本次调查抢救性收集125份疣粒野生稻资源，全部纳入国家高原野生稻种质资源圃保存；进一步对这些疣粒野生稻资源进行白叶枯病抗性鉴定，发现均抗水稻白叶枯病，这为水稻抗病新基因的挖掘提供了宝贵的遗传材料。
关键词： 疣粒野生稻 云南西部地区 濒危植物 资源保护 白叶枯病抗性
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利用RNA-seq技术筛选药用野生稻抗白叶枯病相关基因
《广东农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】药用野生稻(Oryza officinalis)属于稻属CC染色体组，在长期的自然生存过程中，积累了大量适应恶劣环境的抗性基因。利用转录组测序(RNA-seq)挖掘植物抗病相关基因，为开展基因功能与调控机制研究等奠定基础。【方法】对云南省6个居群(Ⅰ～Ⅵ)的38份药用野生稻进行白叶枯病菌CX28-3和PXO99的抗性评价，以PXO99人工接种处理筛选到的药用野生稻36号(抗病)与37号(感病)植株为对象，于0、24、48 h取其叶片进行转录组测序分析，并预测药用野生稻抗白叶枯病相关基因。【结果】6个居群38份云南药用野生稻材料对2个菌株(CX28-3和PXO99)表现为不同的抗病性，总体为中抗至抗以上，其中抗病率最高的是V居群、为93.50%，最低的是III居群、为62.50%。38份药用野生稻对CX28-3菌株感病的植株有5份，感病率为13.15%；对PXO99菌株的感病率为42.10%，表明PXO99的致病力强。此外，抗2个菌株的药用野生稻材料有20份，占全部材料的66.67%，37号材料对2个菌株均表现为中感，36号材料对2个菌株都表现为抗。转录组测序共鉴定到75 650个差异表达基因(DEGs)。GO功能富集分析显示，PXO99处理后共包含45个显著富集的生物进程GO类别，其中富集DEGs数量最多的集中在细胞过程、代谢过程、细胞解剖实体、绑定、催化活性等。KEGG富集分析表明，抗病和感病野生稻材料共显著富集到19个KEGG通路，其中与抗病相关的蛋白等KEGG通路显著富集上升，进一步明确抗病药用野生稻36号的抗病性受白叶枯病菌激发显著。筛选到共同DEGs 256个，11个基因可能与野生稻白叶枯病抗性密切相关；Unigene1184、Unigene15669、CL1239、CL1421、CL4899、CL660、CL7463 7个基因在抗病材料中上调表达，在感病材料中下调表达；Unigene18206、CL210、CL3554、CL9248 5个基因在抗病材料中下调表达，在感病材料中上调表达。【结论】6个居群38份云南药用野生稻材料对CX-28和PXO99菌株表现出不同的白叶枯病抗性，总体为中抗至抗以上。利用RNA-seq技术获得与药用野生稻白叶枯病(PXO99)抗性相关基因11个，可为药用野生稻抗白叶枯病相关基因的挖掘和功能研究提供参考。
关键词： 药用野生稻 白叶枯病抗性 转录组测序 差异表达基因 代谢通路 抗病相关基因
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