科研产出
对甘蔗线条花叶病毒存在抗性差异的2个甘蔗品种中eIF4E基因序列分析
《植物病理学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:甘蔗线条花叶病毒(sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)是近年引起甘蔗花叶病的主要病原,选育和利用抗病品种是防控甘蔗花叶病最经济有效的手段.不同品种对甘蔗花叶病具有不同抗性,明确抗性差异的来源对于选育抗病品种具有重要意义.本研究以SCSMV的高抗品种CP94-1100和高感品种ROC22为对象,对两个品种的致病病毒和真核生物翻译起始因子 4E(eukaryotic translation initiation factor 4E,eIF4E)序列进行分析.在致病病毒方面,侵染 CP94-1100 和 ROC22的SCSMV分离物cp 基因和vpg基因核苷酸序列和蛋白编码情况基本相同,为同一分子变种.在寄主eIF4E方面,从CP94-1100和ROC22中均分离到eIF4E基因,均包含由663 bp构成的ORF,编码1个含220个氨基酸残基的多肽,氨基酸序列同源性仅为98.2%,说明抗性差异可能与eIF4E差异相关.生物信息学分析显示,CP94-1100和ROC22中eIF4E基因编码的蛋白均为稳定亲水性蛋白,属于IF4E家族蛋白,而CP94-1100中eIF4E基因编码的蛋白还包含1个CDC 33或PTZ00040的结构域.遗传分析表明eIF4E基因与禾本科其他作物高度相似,其中CP94-1100的eIF4E基因与割手密亲缘关系最近,说明它们也具有类似的功能.
关键词: 甘蔗线条花叶病毒 抗性差异 外壳蛋白 病毒基因组连接蛋白 真核生物翻译起始因子4E
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