科研产出
侵染番茄的中国番木瓜曲叶病毒基因组结构特征
《西南农业学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：从云南元谋采集表现曲叶症状的番茄样品中分离粉虱传双生病毒(Whitefly-transmitted geminivirus,WTGs)分离物YN678。序列分析表明其DNA-A为单链环状,全序列长度为2739 bp,编码6个ORFs。BLAST比对发现,该分离物与双生病毒科菜豆金色黄花叶病毒属的中国番木瓜曲叶病毒HeNZM1分离物(PaLCuCNV-[HeNZM1])最为接近,相似性为98.5%,表明番茄中的分离物YN678是PaLCuCNV的1个分离物。利用WTGs卫星分子DNAβ特异引物Beta01/Beta02进行PCR扩增、克隆和测序,在YN678中扩增到DNAβ分子,全长为1357 bp,该序列与中国番茄黄曲叶病毒YN149分离物(TYLCCNV-[YN149])伴随的DNAβ相似性最高,达到99.1%。这是首次从云南番茄中分离到中国番木瓜曲叶病毒。
关键词： 中国番木瓜曲叶病毒 中国番茄黄曲叶病毒 番茄 DNA-A DNAβ
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侵染番茄的中国番茄黄化曲叶病毒致病性相关分子的遗传多样性
《云南大学学报(自然科学版) 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：对云南番茄中的中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)不同分离物的致病性相关分子DNAβ进行PCR扩增和克隆.全序列比较分析发现滇西北和滇南各分离物DNAβ同源率较高而且进化关系较近,滇西南与之差异较大.获得的16个DNAβ分离物具有一定的地理分布差异.
关键词： 番茄 中国番茄黄化曲叶病毒 DNAβ 遗传多样性
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赛葵黄脉病毒:一种含有卫星DNA的双生病毒新种
《科学通报 》 2003 北大核心 CSCD
摘要：从云南红河地区表现黄脉症状的杂草——赛葵上分离到病毒分离物Y47.对Y47进行DNA-A的全序列测定,结果表明,Y47 DNA-A全长2731个核苷酸,基因组具有典型的双生病毒科病毒特征,即编码6个ORFs,其中病毒链编码AV1(CP)和AV2共2个ORFs,互补链编码ACl～4共4个ORFs.对基因组进一步比较发现,Y47 DNA-A与秋葵黄脉花叶病毒分离物201(GenBank登录号:AJ002451)的同源性最高,达77％,而与其他双生病毒的同源性均在76％以下,表明Y47是双生病毒的一个新种,命名为赛葵黄脉病毒(MYVV).利用DNAβ的特异性引物beta01和beta02,从Y47中扩增到卫星DNA分子(Y47β).序列分析表明,Y47β全长1348个核苷酸,至少在其互补链上编码一个有功能的ORF(Cl).Y47β的全序列与Multan棉花曲叶病毒和Rajasthan棉花曲叶病毒的DNAβ的核苷酸同源性最高,为62％～67％,而与其他已报道的DNAβ的同源性均低于46％.系统关系树分析表明,卫星DNAβ分子与其辅助病毒是共同进化的.
关键词： 赛葵黄脉病毒 赛葵 Begomovirus DNA-A DNAβ
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与烟草曲叶病毒伴随的新型DNA分子鉴定
《科学通报 》 2002 北大核心 CSCD
摘要：根据已报道的两种粉虱传双生病毒DNAβ分子的保守序列设计引物,利用PCR技术从烟草曲叶病毒Y5和Y8分离物中扩增到一类环状DNAβ分子,其全长分别为1333和1338nt.序列分析表明,Y5DNAβ可能编码8个可读框（ORFs）,病毒链和互补链各含有4个ORFs;Y8 DNAβ可能编码7个ORFs,病毒链含有4个ORFs,互补链含有3个ORFs.除茎环结构TAATATTAC外,DNAβ与烟草曲叶病毒Y5和Y8基因组DNA-A序列几乎无同源性.Y5和Y8的DNAβ全长核苷酸序列同源性较高,为85％,而与已报道的胜红蓟黄脉病毒（AYVV）DNAβ及棉花曲叶病毒（CLCuV）的两个DNAβ的同源性为51％～65％.免疫捕获PCR及粉虱传毒实验表明,DNAβ分子包裹在双生病毒粒子中,并伴随病毒由烟粉虱传播.
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