科研产出
东试早柚与沙田柚和水晶柚遗传背景比较
《园艺学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：'东试早柚'是实生选育出的柚品种,在云南省热带地区种植,具有早熟、丰产、无籽等优点,然而其来源至今尚未厘清,在品种权意识淡薄的栽培地区产生了许多经济纠纷.因此,解析'东试早柚'的遗传来源对保护和利用该品种均具有重要意义.以西双版纳'东试早柚'及其相近品种'沙田柚''水晶柚'为材料,利用分子标记和生物信息等手段探究了 3个品种的遗传背景差异.结果显示,'东试早柚'与'水晶柚'间杂交不亲和,而与'沙田柚'杂交亲和;'东试早柚'和'水晶柚'的自交不亲和S位点基因型均为S5S6,而'沙田柚'为S1S2;'东试早柚'和'水晶柚'全基因组SNP密度分布高度相似,SNP聚类分析将'东试早柚'和'水晶柚'聚为一类,而与'沙田柚'显著区分.此外,2对InDel多态性标记也可明显区分'东试早柚'与'沙田柚'.因此,本研究结果认为'东试早柚'与'水晶柚'遗传背景更为相近,而与'沙田柚'遗传距离较远、相差很大.
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芸薹种作物开花相关基因BrFLC2的InDel标记
《园艺学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：以具有不同开花习性的9份芸薹种作物为试材,根据开花相关基因BrFLC2序列设计引物进行PCR扩增,发现9份材料均获得约1 400 bp的片段。通过克隆测序分析发现9份材料存在片段大小差异,因此开发了与此相关的BrFLC2的InDel标记。通过对来自8个不同栽培种群的146份自然群体材料的基因型检测与开花时间的相关性分析发现:开花时间早晚与BrFLC2的InDel的基因型显著相关(r=0.412,P<0.01)。Del基因型材料开花时间(平均71 d)明显比In基因型(平均109 d)早。研究证明该标记与开花时间表型显著相关,可以用来进行分子标记辅助选择育种。
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