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资源类型: 中文期刊
关键词:PCR扩增(模糊匹配)
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甘蔗梢腐病致病菌甘蔗镰刀菌的分离及鉴定

中国农学通报 2025 CSCD

摘要:甘蔗梢腐病是由多种镰刀菌引起的真菌性病害。为明确云南甘蔗梢腐病病原种类,从云南开远和孟连采集甘蔗梢腐病样品33份,分离纯化得到菌株FS1和FS2,提取其DNA;利用转录延长因子基因(EF-1α)、微管蛋白基因(TUB2)、聚合酶基因(RPB2)引物序列对分离到菌株进行PCR扩增,获得了与目的条带大小一致的清晰明亮条带;将产物测序后在NCBI网站上进行BLAST比对分析,菌株FS1和FS2的EF-1α序列、TUB2序列和RPB2序列与Fusarium sacchari的EF-1α(登录号MK609907.1)、TUB2(登录号MT011039.1)和RPB2(登录号MW238849.1)序列的相似性和覆盖性均为100%;同时通过MEGA6.0软件以最大似然法建立菌株FS1和FS2的系统发育树,发现FS1、FS2与F. sacchari均聚在同一分支上;因此,根据菌株FS1和FS2的形态学特征以及分子生物学鉴定结果,甘蔗梢腐病的病原菌鉴定为F.sacchari。用F. sacchari孢子接种‘云蔗08-1609’,接种7 d叶片出现退绿和叶片黄化症状;将接种发病叶片进行再次分离和测序,分离到菌株EF-1α序列与F. sacchari的EF-1α(登录号MK609907.1)序列的相似性和覆盖性均为100%。研究表明,F. sacchari为开远和孟连引起梢腐病的致病菌。

关键词: 甘蔗 梢腐病 镰刀菌 分离 鉴定 PCR扩增 系统发育分析

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家蚕二分浓核病毒VD1ORF3基因克隆及序列分析

现代农业科技 2025

摘要:家蚕浓核病是一种严重影响蚕业生产的流行病,其病原为家蚕二分浓核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)。为了解云南省鹤庆县蚕区BmBDV的发生情况及病毒的遗传分化情况,在云南省鹤庆县收集到15份疑似浓核病感染的病蚕样本,提取样本基因组DNA,根据家蚕二分浓核病毒-镇江株(BmBDV-3)基因组中VD1链的非结构蛋白基因VD1 ORF3序列设计特异性引物,并以病蚕基因组为模板进行PCR扩增,以检测该地区的病蚕是否感染BmBDV,同时比较VD1 ORF3基因同源性和遗传距离,以该基因片段构建系统发育树。PCR扩增结果显示,该地区有5份病蚕样本扩增到特异性目的片段而确定感染BmBDV。系统进化分析得知,家蚕二分浓核病毒-鹤庆株(BmBDV-Heqing)与已报道的家蚕二分浓核病毒-镇江株(BmBDV-3)亲缘关系最近,说明分离得到的家蚕二分浓核病毒为BmBDV-3的一个分离株系。

关键词: 家蚕二分浓核病毒 PCR扩增 系统发育树 同源性 遗传距离 镇江株 鹤庆株

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烟蚜茧蜂体内Wolbachia的wsp基因分子检测及序列分析

中国植保导刊 2015 北大核心

摘要:采用沃尔巴克氏体(Wolbachia)的通用引物、A大组和B大组的特异性引物对烟蚜茧蜂体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及分子检测,所获得的基因片段分别命名为w Apr、w Apr A和w Apr B,长度分别为620 bp、566 bp和463 bp。基因序列分析表明,w Apr、w Apr A和w Apr B在对应位置序列仅有4个碱基的差异。系统发育分析表明,该寄生蜂仅感染了A大组的Wolbachia。

关键词: 烟蚜茧蜂 Wolbachia PCR扩增 wsp

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