云南3个不同地区水稻矮缩病毒S8片段的序列分析

彭潞波; 魏春红; 方琦; 李婷婷; 董家红; 苏晓霞; 丁铭; 张仲凯; 李毅; 《云南大学学报(自然科学版) 》 2008 北大核心 CSCD

摘要：用RT-PCR方法从云南昆明、玉溪和陆良3个地区的水稻样品中扩增到水稻矮缩病毒S8全长片段,核苷酸测定及序列分析表明,水稻矮缩病毒云南昆明、玉溪及陆良分离物S8片段全长均为1356 bp,含一个1266 bp的ORF,编码421个氨基酸.核苷酸和氨基酸同源性分析表明,4个中国分离物S8片段之间的核苷酸同源性为97.9%,其编码的氨基酸同源性为98.6%;4个中国分离物与日本分离物的S8片段核苷酸同源性和氨基酸相似性分别为94.7%和98.1%.昆明、陆良、玉溪和福建分离物应属同一株系,而日本分离物应属另一株系.

关键词： 水稻矮缩病毒 S8片段 同源性分析