中国南方地区水稻资源SSR指纹数据库的构建及遗传多样性分析

陈越; 陈玲; 李春花; 张敦宇; 付坚; 程在全; 《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：本研究利用SSR分子标记构建了中国南方地区100份水稻资源的SSR指纹图谱身份证并对其进行遗传分析.22对引物共检测到161个等位基因,每对标记检测到2~14个等位基因数(Na),平均每对引物为7.318 2个,多态性信息含量(PIC)为0.269 8~0.859 6,平均0.671 6;根据所用引物扩增条带的缺失情况、引物间的相似性并结合ID Analysis软件分析结果,筛选出RM17、RM21、RM241、RM542、RM5608及RM6371共6对引物,并利用这6对引物构建了可区分100份水稻资源的SSR指纹图谱身份证.结果表明,云南水稻资源在6个省份中遗传多样性水平最高,而广东水稻资源的遗传多样性水平相对较低;对南方地区水稻资源的遗传分化分析发现100份水稻资源的基因流(Nm)为1.637 1>1,表明南方地区水稻资源间存在一定程度的基因交流现象;Structure群体遗传结构分析、PCA主成分分析及UPGMA聚类分析将所有的供试材料分为3大类群,6个省份的水稻资源中除广东和四川的资源按来源聚在一个类群中,其它省份的水稻资源分布于不同的类群中.研究表明,南方地区不同省份水稻资源间的遗传差异较大,构建的南方地区水稻资源SSR指纹图谱身份证及遗传分析的结果可为中国南方地区水稻资源的品种鉴别及遗传差异提供分子水平上的依据.

关键词： 南方地区水稻资源 SSR分子标记 SSR指纹图谱身份证 遗传分析 遗传多样性