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资源类型: 中文期刊
关键词:rDNA(模糊匹配)
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长尖叶蔷薇基于rDNA FISH的核型分析

西南农业学报 2018 北大核心 CSCD

摘要:【目的】为精确地识别蔷薇属植物染色体组的核型特征,文章研究了长尖叶蔷薇基于染色体荧光原位杂交(FISH)的核型。【方法】利用45S和5S rDNA为探针对长尖叶蔷薇有丝分裂中期的染色体进行FISH研究。【结果】长尖叶蔷薇的染色体组有1对45S rDNA位点和2对5S rDNA位点。除4、5号是亚中部着丝点(sm)染色体外,其它都是中部着丝点(m)染色体。4号染色体是1对异形同源染色体,长臂(4L)上有1对5S rDNA杂交位点,其中位于较短染色体上的5S rDNA杂交信号极强; 5号染色体也是1对异形同源染色体,其短臂(5S)上有1对45S rDNA,长臂(5L)上则有另1对5S rDNA,两条染色体上的rDNA信号强度没有明显差异。【结论】以rDNA为探针的FISH能准确地识别长尖叶蔷薇染色体组中的同源染色体,体现其在染色体水平上的特征,为该物种用于现代月季的遗传改良提供了分子细胞遗传学背景资料。

关键词: 蔷薇 rDNA 荧光原位杂交 核型

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蔷薇属3个野生种中45S rDNA和5S rDNA的物理定位

园艺学报 2014 北大核心 CSCD

摘要:采用双色荧光原位杂交(FISH)技术对3个二倍体蔷薇野生种:多苞蔷薇(Rosa multibracteata Helm.et Wils.)、川滇蔷薇(R.soulieana Crép.)和金樱子(R.laevigata Michx.)的体细胞中期染色体进行了45S rDNA和5S rDNA物理定位。结果表明:45S rDNA在这3种蔷薇的染色体上的数量和分布模式较一致,都有1对位点,均位于一对亚中部着丝点异形同源染色体的短臂上。5S rDNA在多苞蔷薇上有1对位点,在川滇蔷薇和金樱子上各有2对位点,都分布于染色体长臂的近着丝点处。这3种蔷薇各自的rDNA位点数量、所在染色体和信号强弱有明显差异。研究结果为识别3种蔷薇各自的染色体提供了明确有效的分子细胞遗传学标记。

关键词: 蔷薇属 rDNA 荧光原位杂交(FISH) 核型

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三七病原根结线虫核糖体基因ITS区段的克隆测序及其在检测中的应用

江西农业大学学报 2008 北大核心 CSCD

摘要:根据NCBI基因库中根结线虫属rDNA序列,设计通用引物M18s/M28s,对采自云南文山、砚山、马关、蒙自等地的4个三七病原根结线虫种群(Meloidogyne hapla)rDNA区段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并将扩增到的目的片段克隆到pGEM-T载体上。对重组克隆进行测序和序列分析,结果表明:4个种群rDNA同源性为100%,ITS区序列长度为479 bp,其中ITS1序列长度为213 bp,5.8S序列长度为159 bp,ITS2序列长度为107 bp。根据此序列设计-对特异性寡聚核苷酸引物Mhf/Mhr,应用PCR技术,以北方根结线虫(Meloidogynehapla)、南方根结线虫(Meloidogyne incognita)、花生根结线虫(Meloidogyne arenaria)和爪哇根结线虫(Meloido-gyne javanica)全基因组DNA为对照,对三七病原根结线虫全基因组DNA进行特异性扩增。结果表明,该对引物能从供试的北方根结线虫和三七病原根结线虫种群全基因组DNA中扩增到462 bp长度的分子片段,而南方根结线虫、花生根结线虫和爪哇根结线虫则无扩增产物。该引物可用于三七病原根结线虫的检测。

关键词: 三七病原根结线虫 rDNA 序列分析 检测

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伞滑刃线虫属4个种rDNA的PCR扩增

云南农业大学学报 2003 CSCD

摘要:从161份病松树样本中分离、鉴定出拟松材线虫(Bursaphelenchusmucronatus)、霍夫曼伞滑刃线虫(B.hof manni)和赫列尼库斯伞滑刃线虫(B.hellenicus)3个种,其中后二者是中国新记录种,华山松和云南松分别是这两个种的世界新寄主记录。本试验以松材线虫(B.xylophilus)为对照,用伞滑刃属线虫rDNA相关引物对这4种伞滑刃线虫进行PCR扩增,进一步印证形态鉴定的可靠性。试验结果表明,霍夫曼伞滑刃线虫、赫列尼库斯伞滑刃线虫与松材线虫、拟松材线虫,均扩增到约800bp的分子片段,为霍夫曼伞滑刃线虫和赫列尼库斯伞滑刃线虫的鉴定从分子生物学角度提供了一定依据。

关键词: 伞滑刃线虫 rDNA PCR

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