科研产出
侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒全基因组结构特征
《植物保护 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确假酸浆Nicandra physalodes叶片黄化、皱缩症状是否由菜豆金色花叶病毒属病毒侵染引起，本研究利用分子检测方法和生物信息学技术鉴定了假酸浆样品中的病毒种类。从采集的病样中克隆并获得了2条菜豆金色花叶病毒属病毒DNA-A全序列和1条beta卫星全序列，经全序列分析发现，该双生病毒的两条DNA-A全序列与泰国番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl Thailand virus, TYLCTHV）云南分离物TYLCTHV-YN1732一致性最高，达99.3%,亲缘关系较近；beta卫星的全序列与云南番茄曲叶beta卫星（tomato leaf curl Yunnan betasatellite, TLCYnB）的分离物YN5230一致性最高，达99.3%,亲缘关系较近。重组分析显示，假酸浆上分离的TYLCTHV-YN5735-12是一个重组病毒，有两个重组事件，一个主要发生在AV1的编码区，由中国番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl China virus, TYLCCNV）和广西大戟曲叶病毒（euphorbia leaf curl Guangxi virus, EuLCGXV）重组形成，另一个重组事件主要发生在基因间隔区（IR区）,由泰国烟草卷叶病毒（tobacco leaf curl Thailand virus, TbLCTHV）和TYLCTHV重组形成。研究结果表明，假酸浆是TYLCTHV的新寄主，这是单组分菜豆金色花叶病毒属病毒及其伴随beta卫星侵染假酸浆的首次报道。
关键词： 假酸浆 泰国番茄黄化曲叶病毒 基因组特征 重组
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一种侵染鳢肠的双生病毒基因组特征
《植物病理学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：菜豆金色花叶病毒属病毒是热带及亚热带地区经济作物的重要病原病毒,该类病毒在田间的杂草寄主范围较为广泛。本研究从云南红河流域采集到叶脉黄化的鳢肠植株,经克隆获得了菜豆金色花叶病毒属病毒分离物YN3306,该分离物核苷酸序列全长2749 nt,具有典型的双生病毒基因组结构特征。进一步分析发现,分离物属于金腰剑曲叶病毒(Synedrella leaf curl virus,SyLCV),RDP软件分析表明,该分离物是由烟草曲茎病毒(Tobacco curly shoot virus,Tb CSV)、云南烟草曲叶病毒(Tobacco leaf curl Yunnan virus,TbLCYnV)和金腰剑曲叶病毒重组产生的病毒。本研究首次报道了GenBank中在印度注册的SyLCV可以侵染鳢肠植株。
关键词： 鳢肠 菜豆金色花叶病毒属病毒 基因组 重组
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云南凹头苋上分离到的2种菜豆金色花叶病毒属病毒基因组结构特征
《植物病理学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)病毒是热带亚热带地区多种作物的重要病原,杂草作为该属病毒的中间寄主在病害发生流行中具有重要作用。本研究通过克隆、测序和生物信息学分析,对3株具有曲叶症状的凹头苋(Amaranthus lividus)进行菜豆金色花叶病毒属病毒的分离分析。从这些凹头苋中共分离到2种菜豆金色花叶病毒属病毒和3种beta卫星。序列分析显示,其中一种病毒与云南番茄黄化曲叶病毒相似性最高(96%),另一种与中国胜红蓟黄脉病毒相似性最高(96.5%或91%)。Beta卫星的分析显示,其中一种与云南番茄黄化曲叶beta卫星相似性最高(94.3%),另一种与赛葵曲叶beta卫星相似性最高(92%),最后一种与中国番茄曲叶beta卫星相似性最高(91%)。重组分析表明,分离物YN4331-69是一个重组病毒,是由中国胜红蓟黄脉病毒YN4326-60和一个尚未发现的菜豆金色花叶病毒属病毒重组形成。这是首次报道凹头苋被不同的菜豆金色花叶病毒属病毒及其伴随的beta卫星侵染,表明凹头苋是一个适宜该属病毒的中间寄主。
关键词： 菜豆金色花叶病毒属病毒 凹头苋 复合侵染 重组
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两种菜豆金色花叶病毒属病毒复合侵染番茄及重组特征
《园艺学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：由菜豆金色花叶病毒属病毒引起的番茄曲叶病严重制约着世界范围内番茄的生产。自然条件下复合侵染引起的重组或假重组可能产生新株系、新种或新的病害复合体,导致致病性增强或减弱。从云南红河地区表现叶片黄化并伴随植株矮化的一株番茄中,获得了Y3080-32和Y3080-40两个菜豆金色花叶病毒属病毒分离物以及Y3080-1和Y3080-2两个beta卫星分离物。序列比对表明,Y3080-32属于红河赛葵黄脉病毒(MaYVHoV)分离物,Y3080-40属于云南辣椒曲叶病毒(Pep LCYn V)分离物。重组分析显示,分离物Y3080-32是重组病毒,由MaYVHoV和Pep LCYn V(Y3080-40)重组产生。Y3080-1和Y3080-2是赛葵黄脉beta卫星(Ma YVB)分离物。Ma YVHo V/Ma YVB复合体和Pep LCYn V复合侵染番茄,表明菜豆金色花叶病毒属病毒的复合侵染为重组和假重组的发生提供了机会。
关键词： 菜豆金色花叶病毒属病毒 番茄曲叶病 beta卫星 复合侵染 重组
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从云南分离的烟草曲顶病毒为菜豆金色花叶病毒属的一个新种
《科学通报 》 2001 北大核心 CSCD
摘要：从我国云南省保山地区烟草上表现曲顶症状的植株上分离获得病毒分离物Y1, 经粉虱传毒及粒子形态观察, 证明为菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)病毒. 用14种单克隆抗体进行三抗体夹心ELISA测定, 结果表明Y1与我国及巴基斯坦、印度等国报道的双生病毒的抗原表位型均不同. 对Y1基因组DNA-A的全序列进行了分析, 全长2746个核苷酸, 其中病毒链含有两个ORF, 互补链含有4个ORF. Y1与其他双生病毒基因组DNA-A全序列、基因间隔区序列及各ORF编码的氨基酸序列的比较分析表明, Y1是一种新的Begomovirus病毒, 定名为烟草曲顶病毒, 英文名为Tobacco curly top virus, 简称TCTV. TCTV全基因组与印度报道的番茄曲叶病毒和番木瓜曲叶病毒的同源性最高, 达85%, 而其CP基因与巴基斯坦棉花曲叶病毒分离物72 b高度同源, 氨基酸水平的同源性达98%.
关键词： 烟草曲顶病毒 Begomovirus 新种 重组
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