科研产出
大叶茶树群体种及杂交F1代表型性状遗传多样性分析及评价
《江苏农业科学 》 2023 北大核心
摘要：为了深入研究茶树大叶群体种及杂交F1代表型性状遗传多样性，为大叶茶树品种的选育及应用提供理论指导，以26份大叶茶树群体种及26份杂交F1代材料为试验对象，对其芽叶的12个表型性状多样性进行调查研究，并对测定结果进行主成分分析、相关性分析和聚类分析。结果表明，52份材料的表型性状表现出丰富的多样性和变异，其中，群体种平均变异系数达20.68%,杂交F1代材料平均变异系数为16.88%。相关性分析结果显示，群体种66对相关性分析中有32对达到极显著水平（P＜0.01）,6对达到显著水平（P＜0.05）。杂交F1代材料66对相关性分析中有53对达到极显著水平（P＜0.01）,4对达到显著水平（P＜0.05）;多变量主成分分析表明，群体种的前3个主成分代表了26份材料表型多样性84.251%的信息，杂交F1代材料的前2个主成分代表了26份材料表型多样性81.964%的信息；聚类分析显示，52份材料被分为了两大类群，第1类群分为2个亚类，聚集了群体种和杂交F1代的材料；第2类群分为2个亚类，聚集的均为群体种材料。52份大叶茶树群体种及杂交F1代材料表型遗传多样性丰富，变异系数大，相较于群体种，杂交F1代的遗传特征较稳定。
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滇龙胆居群遗传多样性和遗传结构分析
《中草药 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的 揭示不同分布区滇龙胆Gentiana rigescens的遗传多样性与遗传结构。方法 基于GBS（genotyping-by-sequencing）简化基因组（reduced-representation genome sequencing,RRGS）技术对采自云南、四川和贵州的19个居群147株滇龙胆进行测序；利用样本SNPs数据集结合聚类树分析、主成分分析、遗传结构分析、Mantel检验等方法，从基因组水平研究滇龙胆居群的遗传多样性与遗传结构；结果 聚类树分析、主成分分析及遗传结构分析显示，不同分布区采集的样品有明显的基因型差异；依据样品地理来源，19个居群大致可分为横断山区（分布于滇西北和川西南的居群）及云贵高原（分布于滇西、滇中、滇东南及贵州的居群）2个亚群。通过观测观测杂合度（observed heterozygosity,Ho）、期望杂合度（expected heterozygosity,He）、多态信息含量（polymorphic information,PIC）、Shannon多样性指数（shannon’s diversity index,I）、Nei’s多样性指数（Nei’s gene diversity,Nei’s）、核苷酸多样性（nucleotide diversity，π）比较，发现云贵高原的居群遗传多样性高于横断山区的居群(云贵高原居群遗传多样性参数均值：Ho=0.052,He=0.110,PIC=0.088,I=0.164,Nei’s=0.127，π=1.677×10-3；横断山区居群遗传多样性参数均值：Ho=0.051,He=0.098,PIC=0.077,I=0.144,Nei’s=0.114，π=1.175×10-3)；居群遗传分化系数（genetic differentiation index,FST）和基因流（gene flow,Nm）分析显示，滇龙胆居群间存在一定的遗传分化和基因流；遗传变异分析（AMOVA）显示滇龙胆种内变异主要来自居群内；基于23个环境变量的环境差异分析显示，横断山亚群与云贵高原亚群生境的热量与UV-B辐射存在差异；Mantel检验显示，居群间的遗传分化主要由环境差异导致，其中UV-B辐射与居群FST呈极显著正相关（P＜0.01）。结论 横断山区与云贵高原滇龙胆居群遗传结构和遗传多样性具有差异，分布区UV-B辐射变化可能是驱动滇龙胆居群遗传分化的重要因素。
关键词： 滇龙胆 遗传多样性 遗传结构 简化基因组测序 资源评价
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191份云南野生甘蔗种质资源采集及遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】收集云南野生甘蔗种质资源，并进行遗传多样性分析，筛选出优异种质资源，为甘蔗遗传改良提供优良亲本，也为利用和保护甘蔗野生种质资源提供理论依据。【方法】甘蔗野生种质资源采集按每隔30 km或海拔落差100 m取样1次，记录考察采集路线地理信息，调查表型性状和采集图像，并取地下根茎（地下种芽）样本保存。通过遗传变异分析、相关分析及聚类分析对6个表型性状进行综合评价，并分析其遗传多样性。【结果】甘蔗野生资源考察队历时20 d途经11个县（市）51个乡镇，共采集到191份甘蔗野生种质资源，隶属于3个属5个种，其中滇蔗茅（Erianthusrockii）42份、割手密（Sacchuramspontaneum）53份、芒（Micanthussinensis）20份、斑茅（Erianthusarundinacius）35份、蔗茅（Erianthus fulvus）41份，主要分布于23°12′0″N～25°18′0″N,101°51′0″E～104°36′0″E和海拔208.45～2238.71 m地理区域。甘蔗野生资源种间表型性状变异丰富，表型性状的变异系数18.33%～51.76%，其中割手密的平均变异系数最高，为40.95%，其次为斑茅，平均变异系数为38.61%，芒的平均变异系数最小，为33.80%。纬度和海拔均与叶宽、株高和茎径呈极显著负相关（P＜0.01），而锤度与经度、纬度和海拔无显著相关性（P＞0.05）。通过聚类分析及优异资源筛选，发现滇蔗茅种质第Ⅲ类群（Er2021-29）、割手密种质第Ⅱ类群（Sp2021-25、Sp2021-26和Sp2021-21）、芒种质第Ⅱ类群（Ma2021-15），斑茅种质第Ⅳ类群（Ea2021-8）、蔗茅种质第Ⅰ类群（Ef2021-1）共7份材料产量性状和品质性状优良。【结论】此次野生甘蔗种质资源采集行动弥补国家甘蔗种质资源圃（开远）在云南省境内部分县（市）考察盲区系统调查的空白，且采集的191份甘蔗野生种质资源表型性状具有丰富的遗传多样性，部分特异材料具有其他甘蔗野生资源所不具备的优异性状，有7份种质综合表现优异，具有较大的利用潜力。
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基于云南玉米杂交种测试的性状多样性及相关性分析
《广东农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】评价当前玉米品种特异性（Distinctness）、一致性（Uniformity）、稳定性（Stability）测试（DUS测试）性状在玉米杂交品种上的应用。【方法】以2020—2021年进行玉米DUS测试的云南地区89个杂交品种为材料，在测试数据基础上，对38个测试性状进行多样性、相关性分析，以及对89个品种进行聚类分析。【结果】38个性状在89个玉米杂交品种中共检测到191个表达状态，平均每个性状检测到5.0263个，变幅为2～8个；平均有效表达状态为2.8217，变幅为1.0227～6.0697;38个性状平均Shannon-Weaver多样性指数为1.0669，变幅为0.0616～1.9069。不同性状的多样性表现差异较大，有的性状在89个玉米品种中仅出现2种表达状态，有效表达状态数和Shannon-Weaver多样性指数均比较低；有些性状在89个玉米品种中出现8种表达状态，有效表达状态数和Shannon-Weaver多样性指数均比较高。38个测试性状中，有12对性状间存在极显著正相关关系，散粉期与抽丝期、植株穗位高度与穗位高/株高比率间的相关性系数较高，分别为0.94和0.90。上述结果表明，当前玉米DUS测试指南中测试性状在杂交种中的多样性较好，品种区分力强，对存在极显著相关的性状，在特异性判定、实质性派生品种判定时需作特殊考虑，可以根据其重要性赋予不同权重，以校准判定结果。聚类分析显示，89个杂交种的相似系数为0.24～0.53，可聚类为5大类群，其中第Ⅳ类群包含81个品种（占91.0%），该类群中最相近的品种相似性系数为0.53，表明云南玉米杂交种多样性较好、品种间差异明显。【结论】当前玉米DUS测试性状在玉米杂交品种测试依然保持较高的区分力，测试性状多样性丰富，且有12对测试性状间存在极显著的正相关性。
关键词： 杂交玉米 DUS测试性状 多样性 相关性 相似系数
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厚皮甜瓜种质资源果实性状的综合分析及评价
《中国瓜菜 》 2023
摘要：为筛选优质的厚皮甜瓜种质资源，对141份厚皮甜瓜材料的29个果实性状进行了遗传多样性指数分析、变异分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析。结果表明，29个果实性状包括15个质量性状和14个数量性状，其遗传多样性指数平均值分别为0.90、2.01,14个数量性状的变异系数为21.18%，表明其具有丰富的遗传多样性。各数量性状间存在复杂的相关关系，其中果实横径和种腔横径均与中心可溶性固形物含量呈极显著正相关，单果质量与单株产量、千粒重呈极显著正相关，与中心可溶性固形物含量、种形指数呈显著正相关，表明果实的农艺性状与果实的品质、产量具有关联性。主成分分析结果表明，厚皮甜瓜种质资源果实性状的绝大部分信息包含在前4个主成分因子中，累积贡献率为78.39%；综合评价结果表明，SL 42、SL 29、2020 T 20、SL 90、SL 75的表现最好。聚类分析将141份厚皮甜瓜种质资源划分为7个品种群，分别包含4、2、1、48、7、6、73份种质。综上，参试的厚皮甜瓜种质资源果实遗传多样性丰富，各类群特征和优点突出，对品种改良和大面积推广种植具有指导意义。
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茶树品种紫娟及其诱变后代生化成分分析和聚类分析
《湖北农业科学 》 2022 北大核心
摘要：对茶树品种紫娟及其诱变后代进行生化成分分析和聚类分析.结果表明,春季、夏季紫娟及其诱变后代的生化成分含量各有差异,其中两季变异系数最大的是花青素含量,都达70%以上.通过微卫星标记进行遗传多样性分析,结果表明,紫娟与诱变后代相比,其遗传距离都大于0.7,其中亚群诱变后代ZJ07和ZJ15之间的遗传距离最大达0.9以上.生化成分分析和聚类分析都表明,紫娟及其诱变后代遗传多样性较丰富,特别是茶多酚的含量及变异系数,其中春茶的变异系数为13.99%,夏茶的变异系数较低,为6.57%,因此可以得出,样本间的遗传距离越大,茶多酚的含量越高.
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月季花部性状表型多样性研究
《西南林业大学学报 》 2022 北大核心
摘要：为研究月季花部性状的遗传多样性,从73份月季资源中选定了 9个花部性状进行相关分析、聚类分析、主成分分析和综合评价.结果表明:月季各品种间存在显著不同,遗传多样性变异丰富.其中,6个定量性状的变异系数均值为64.00%,花头数的变异系数最大;定量描述性状的多样性大于定性描述性状的多样性,花瓣数的多样性指数最大.73份月季品种中存在极显著相关的性状有15对;在欧氏距离为10处可将73份月季品种划分为3组;前3个主成分能够表现出9个花部性状的多数信息,累计贡献率为71.19%,贡献率最大的为第一主成分,达44.50%.73份月季资源中'绯扇月季'的综合得分最高,'无刺野玫瑰'的综合得分最低,结合逐步回归分析筛选出花朵直径、花瓣长、花瓣宽、花瓣面积和花头数可作为月季花部性状的综合评价指标.
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基于SSR标记的花菜类作物遗传多样性及群体结构分析
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]为了解花菜类种质的遗传基础,分析种质群体的亲缘关系,为花菜育种提供参考.[方法]选用22对SSR引物,利用毛细管电泳荧光检测技术对96份花菜类种质材料进行遗传多样性分析,根据Nei's遗传距离和非加权配对法(UPGMA)进行聚类分析以及以Structure软件的混合模型聚类法推断材料构成群体的遗传结构.[结果]22对引物在96份材料中共扩增出91个等位位点,平均每对引物为4.136个.从22对引物中筛选出了 10对条带清晰、稳定性好的多态性引物,可用于花菜类作物种质资源的鉴定和研究.根据花球性状,将材料分为青花菜(24份)以及花椰菜(72份)2个组群,经多态性分析,2个组群的观察等位基因数值(Na)分别为2.727和3.091;有效等位基因数(Ne)分别为1.910和1.841;Shannon's指数(I)分别为0.675和0.667,说明这2个组群的遗传多样性均不够丰富.聚类分析也将96份材料分为2个组群,第I组为24份青花菜材料,包括1份西兰苔杂交种和23份青花菜杂交种;第Ⅱ组为72份花椰菜材料,包括29份花椰菜自交系、36份花椰菜杂交种和7份花椰菜主栽品种.花椰菜自交系被分到了 4个亚群,但在各亚群中材料之间的遗传距离较小,杂交组配时,选用不同亚群的自交系进行组配,以获得更大的杂交优势.群体结构分析中,当K=2时,AK出现明显的峰值,最大值为1658.48,为最佳群体组群数,与聚类分析结果基本一致.且96份材料的Q值均大于0.6,说明该花菜资源的遗传结构较为单一.[结论]所参试材料种质群体内遗传多样性不够丰富,遗传背景单一,亟需重视对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用,加强种质材料共享和交流,促进花菜种业发展.
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云南稻种资源稻飞虱抗性多样性的生态地理分布研究
《作物杂志 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探讨云南丰富生态地理环境中稻种资源稻飞虱抗性多样性的分布规律，观察分析了3703份稻种资源（1561份稻褐飞虱和2142份稻白背飞虱）的稻飞虱抗性多样性在云南不同气候类型、海拔、日照时数、气温、降水量和稻作区划中的地理分布和差异表现。结果表明，稻飞虱抗性多样性富集程度较高的地区在云南省滇中西部的保山市（龙陵县、施甸县、昌宁县、隆阳区、腾冲市）、大理白族自治州（漾鼻县、永平县）和楚雄彝族自治州（永仁县、双柏县、武定县）。气候类型、海拔、日照时数、气温和降水量是影响稻种资源稻飞虱抗性多样性的主要因素，稻飞虱抗性多样性富聚的气候类型为南亚热带和中亚热带、海拔600.1～800.0m、日照时数1600.1～1900.0h、年均气温13.1℃～15.0℃、年均降水量1100.1～1300.0mm。此外，筛选了11份值得研究利用的优异双抗虫稻种资源。
关键词： 云南稻种资源 稻飞虱 抗虫性 多样性 生态地理分布
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