科研产出
基于高通量测序的苹果根腐病病株和健株根际土壤细菌组成与多样性分析
《西南农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】揭示苹果感染根腐病后,根际土壤细菌群落结构、多样性变化。【方法】分别对感染根腐病和健康苹果植株根际土壤中细菌的16S rRNA基因V3～V4区进行扩增,并利用Illumina Hiseq高通量测序技术进行测序,分析苹果根腐病病株和健株根际土壤细菌物种组成及多样性。【结果】健康、患病苹果根际土壤共获得2526个OTU,主要分为31个门、70个纲、284个科、533个属,其中患病土壤特有260个OTU,健康土样特有103个OTU。α多样性分析显示,患病土壤中细菌多样性显著高于健康土壤。健康土样中,Actinobacteria的相对丰度显著高于患病土样,Acidobacteria显著低于患病土样。苹果根际土壤中,存在Pseudomonas、Bacillus、Arthrobacter、Erwinia、Flavobacterium、Rhizobium、Serratia和Microbacterium等促生微生物,健康土样中,有益菌Arthrobacter的相对丰度显著高于患病土样。【结论】苹果感染根腐病后,根际土壤细菌的物种多样性、群落多样性显著升高。放线菌门和酸杆菌门的平衡,可能对苹果根际土壤的健康有重要作用。苹果根际土壤中,存在大量的潜在植物促生细菌,是将来筛选土著生防菌的潜在资源。
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诺邓火腿加工过程中细菌群落的动态变化
《食品工业科技 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为研究诺邓火腿内部细菌的群落组成及动态变化,本文利用高通量测序技术对诺邓火腿腌制期、风干期、发酵期和成熟期4个加工阶段的细菌16S rRNA V3-V4区进行扩增和测序,并对其群落结构多样性及其与火腿理化性质的关联性进行分析.结果表明,腌制期诺邓火腿细菌多样性最高;厚壁菌门、变形菌门、放线菌门、拟杆菌门等细菌为发酵过程中优势菌群;葡萄球菌属、嗜冷杆菌属及假单胞菌属等在4个加工阶段均有分布;整个加工过程中丰度占比最高的为葡萄球菌属.含水量对腌制期细菌群落影响最大,成熟期含水量下降至33.4%左右;含盐量对风干期和发酵期样本影响最明显,在这两个时期丰度占比最高的葡萄球菌属与含盐量显著正相关,成熟期含盐量增加至约6.7%;酸碱度及游离氨基酸含量与成熟期样本关联度最大,这个时期的酸碱度为6.05左右,游离氨基酸达1.86%.通过以上研究将为理解诺邓火腿特殊品质的微生物影响机制,开发能够改善肉制品品质、提高发酵效率的发酵剂提供参考.
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茶树品种"紫娟"及其诱变后代遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探明茶树品种"紫娟"及诱变后代的遗传多样性。【方法】对选定的"紫娟"及"紫娟"诱变后代材料开展植物学性状调查、生化成分分析及EST-SSR标记研究。【结果】通过植物性状调查,有15份材料芽叶色泽与"紫娟"相近,成熟叶片的叶形只有2份材料与"紫娟"相同,为披针形,其余的为椭圆形或长椭圆形;叶色与"紫娟"相同的有9份材料,都为紫绿色,有7份材料叶色为黄绿色;春、夏两季生化成分的变异系数最高的为花青素,春季达到72.16%,夏季达到77.86%,花青素含量变化夏季大于春季;通过微卫星标记,共检测出165个等位基因,平均等位基因数为7.5个,有效等位基因数为2.562,Shannon信息指数为0.997,多态性信息含量为0.492,观测杂合度为0.629,期望杂合度为0.565。【结论】无论从性状、生理生化还是微卫星标记分析,"紫娟"的诱变后代都具有较为丰富的遗传多样性。
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印度鹰嘴豆资源遗传多样性分析及优异资源筛选
《中国农业科技导报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了解并有效利用印度鹰嘴豆种质资源农艺性状的多样性,通过遗传多样性分析、聚类分析、主成分分析和综合D值评价等方法对181份印度鹰嘴豆资源的12个农艺性状的多样性水平进行分析,筛选可用于评价鹰嘴豆资源的农艺性状及综合表现良好的种质。结果表明:12个表型性状的变异系数范围为7.47%（播种至开花期天数）～85.26%（秕荚数）,百粒重、分枝数、有效分枝数、实荚数、见花至开花期天数、产量、单株产量和秕荚数的变异系数均大30%,具有很好的改良潜力;Shannon多样性指数范围为1.750 9（单株产量）～2.053 5（单荚粒数）,平均值为1.930 2,单荚粒数、株高、有效枝数和播种至见花期天数的多样性指数均大于2.000 0,12个农艺性状的遗传多样性指数均大于1.700 0,说明各性状的数量指标分布较为均匀;在欧式距离为3.41处,181份印度鹰嘴豆资源被分为9个类群,各类群资源数量不同,第Ⅰ～Ⅷ类群均具有一定的性状优势;筛选到4个可用于综合评价印度鹰嘴豆资源的主要表型性状,分别为实荚数、播种至开花期天数、株高、分枝数;利用综合D值评价筛选到31份综合表现较好的资源,为我国鹰嘴豆种质创新和新品种选育提供理论基础和优异的基础材料、亲本来源。
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间伐和不同引种植物对刺槐林下群落的影响
《西南农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】了解不同密度纯刺槐林和不同引种植被混交林群落类型对其灌、草层物种分布格局与群落结构的影响。【方法】在纸房沟和燕儿沟两个流域,分别以不同密度的纯刺槐林和刺槐与不同类型植被混交林为研究对象,深入分析了物种多样性指数变化特征,探讨了不同条件林分类型对植被物种多样性的影响。【结果】在纯刺槐林群落环境下,蛇莓蛇、葡萄和杠柳是主要灌木层优势种,铁杆蒿和紫苑是主要草本层优势种;在中密度水平下,灌木物种多样性最好,低密度水平下,则草本物种多样性最好。在混交林群落环境下,蛇莓和杠柳是灌木层优势种,铁杆蒿是草本层优势种;刺槐和低密度臭柏混交林群落环境下,灌木物种多样性表现较好,刺槐和高密度臭柏混交林群落环境下,草本物种多样性表现最好。【结论】刺槐林群落乔木优势种密度水平对灌、草层物种多样性影响明显,乔木层密度水平降低能有效促进灌、草层物种多样性增加,其中,在中密度水平下灌木层物种多样性增加,低密度水平下草本层物种多样性增加。
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中国南方地区水稻资源SSR指纹数据库的构建及遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：本研究利用SSR分子标记构建了中国南方地区100份水稻资源的SSR指纹图谱身份证并对其进行遗传分析.22对引物共检测到161个等位基因,每对标记检测到2~14个等位基因数(Na),平均每对引物为7.318 2个,多态性信息含量(PIC)为0.269 8~0.859 6,平均0.671 6;根据所用引物扩增条带的缺失情况、引物间的相似性并结合ID Analysis软件分析结果,筛选出RM17、RM21、RM241、RM542、RM5608及RM6371共6对引物,并利用这6对引物构建了可区分100份水稻资源的SSR指纹图谱身份证.结果表明,云南水稻资源在6个省份中遗传多样性水平最高,而广东水稻资源的遗传多样性水平相对较低;对南方地区水稻资源的遗传分化分析发现100份水稻资源的基因流(Nm)为1.637 1>1,表明南方地区水稻资源间存在一定程度的基因交流现象;Structure群体遗传结构分析、PCA主成分分析及UPGMA聚类分析将所有的供试材料分为3大类群,6个省份的水稻资源中除广东和四川的资源按来源聚在一个类群中,其它省份的水稻资源分布于不同的类群中.研究表明,南方地区不同省份水稻资源间的遗传差异较大,构建的南方地区水稻资源SSR指纹图谱身份证及遗传分析的结果可为中国南方地区水稻资源的品种鉴别及遗传差异提供分子水平上的依据.
关键词： 南方地区水稻资源 SSR分子标记 SSR指纹图谱身份证 遗传分析 遗传多样性
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云南育成小麦品种（系）品质性状遗传多样性分析及综合评价
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：【目的】深入了解云南育成小麦品种(系)的品质性状遗传多样性水平及其综合品质,为拓宽云南小麦品质遗传基础和选育不同类型的优质小麦新品种提供理论依据。【方法】以2008—2018年参加云南省小麦区域试验的171份品种(系)为试验材料,通过Shannon-Wiener多样性指数(H')计算、聚类分析、相关分析、主成分分析、逐步回归分析及线性回归分析等对云南育成小麦的13个品质性状进行多样性分析与综合评价,并剖析主要品质性状的演变规律。【结果】云南育成小麦品种(系)13个品质性状的H'为1.555～2.060,平均为1.916,其中粗蛋白含量的H'最大,稳定时间的H'最小,且地麦品种(系)的品质性状遗传多样性高于田麦品种(系)。在欧式距离3.0处可将171份云南育成小麦品种(系)分为六大类群,大部分供试小麦按栽培类型聚类在一起,少部分交错分布在每个类群中。小麦品种(系)的品质性状综合评价值(D)越高,其综合品质性状越优,具体排序为强筋小麦>中强筋小麦>中筋小麦>弱筋小麦。容重、粗蛋白含量、吸水率、评价值和延伸性等5个品质性状作为自变量的变化能解释D总变异的97.83%,可作为云南小麦品质综合表现的评价指标,其中,吸水率随参试年度推移呈不明显的降低趋势,容重、粗蛋白含量、评价值和延伸性均随参试年度推移呈上升趋势。【结论】云南育成小麦品种(系)品质性状具有较高的遗传多样性,容重、粗蛋白含量、吸水率、评价值和延伸性等5个品质性状可作为云南小麦品质综合表现的评价指标。综合品质性状较优的云麦109和凤1128可作为云南小麦品质育种的首选亲本资源。
关键词： 小麦 品质性状 遗传多样性 综合评价 演变规律 云南
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丽江木本油料青刺果资源调查
《农学学报 》 2020
摘要：为探讨青刺果资源的分布现状和多样性,笔者收集丽江市境内12个乡镇及玉龙雪山风景区内121份青刺果资源,并对此进行调查和评价。结果表明:丽江青刺果集中分布在2000～3200 m海拔区域,在海拔1800 m以上的区域都有分布。青刺果花期在11月—次年3月,果期在4—7月;青刺果有耐寒、耐旱、耐贫瘠的特点。丽江目前野生青刺果面积为3400 hm~2,人工栽培面积为6800 hm~2。不同海拔、地域的青刺果在物候期、种子大小、百粒重等方面有明显的差异。种子性状分析表明,丽江青刺果有着丰富的表型性状多样性;最大和最小的种子,在纵、横、侧三径上长度相差都在2倍左右;种子最重单粒重为0.408 g,最轻的为0.056 g,相差7.3倍;103份资源的百粒重在10～20 g之间;种子的饱满度在30%～100%之间,有5份资源饱满度为100%。本调查结果将为青刺果遗传多样性研究和育种利用提供参考。
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云南省小麦育成品种(系)遗传多样性分析
《西南农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]进一步挖掘云南省小麦育成品种(系)中的优异资源,进而为云南省的小麦育种实践提供一定的理论依据.[方法]采用91对SSR标记对云南省20世纪50年代以来育成的159个小麦品种(系)进行遗传多样性分析.[结果]①91对SSR引物扫描159个云南省小麦育成品种(系),共有360个等位变异被检测到,单个SSR标记检测到1~9个等位变异,平均每个SSR标记检测到3.96个等位变异;各位点的多态性信息指数最低为0,最高为0.8408,所有位点多态性信息指数平均值为0.4677;云南省80年代小麦育成品种(系)的多态性信息指数最高(0.461).②基于Nei's遗传距离的UPGMA聚类可将云南省小麦品种(系)划分为14个类群,类群分类主要与选育年代、栽培类型及种植区域有关.③云南省小麦育成品种(系)的穗粒数和千粒重连锁标记的优异等位变异的频率随着其育成年代的推移而逐渐增长,但穗粒数性状相比千粒重性状改良效果更强.[结论]云南省小麦育成品种(系)遗传多样性较好,特别是20世纪80年代育成品种(系),且不同年代小麦育成品种(系)的穗粒数和千粒重的遗传背景具有不同程度的改良.
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基于SSR分子标记数据构建割手密核心种质库
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以92份割手密初级核心种质为研究对象,利用SSR分子标记数据,依据Jaccard、SM和Nei&Li 3种遗传相似性系数逐步进行UPGMA聚类、多次抽样构建割手密核心种质库.结果显示:92份样本在15个SSR位点上呈现出丰富的多态性,共获得331个多态性条带,平均多态性条带比例达100%;利用3种遗传相似性系数和随机取样共获得5个核心种质库;Shannon-Wiener多样性指数、总条带数和多态性条带数3个指标在核心种质库代表性检验中呈现出较高的检测效率,其他6个指标检测效率相对较低;5个核心库中依据SM遗传相似性系数逐步构建的核心种质库质量最优,该库由80份样本组成,Nei's多样性指数和Shannon?Wiener多样性指数分别为0.9841和4.2598,在P<0.05概率条件下与原库(分别为0.9856和4.3583)无显著差异,而且与原库的农艺性状均值差异百分率为0(<20.00%),极差符合率为99.16%(>80.00%).研究认为,依据SM相似性系数,通过UPGMA聚类构建的80份割手密核心种质较好地代表了基础原始种质的分子水平和表型遗传多样性,可为后续割手密种质资源的精准鉴定、优异抗性基因发掘和种质资源杂交利用提供依据.
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