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云南花生丛枝植原体secY基因序列分析及结构预测

文献类型： 中文期刊

作者： 万琼莲 1 ; 蔡红 1 ; 杨子祥 2 ; 王连春 1 ; 陈海如 1 ;

作者机构： 1.云南农业大学植物病理重点实验室

2.云南省农业科学院热区生态农业研究所

关键词： 花生丛枝植原体;云南;secY基因;序列分析

期刊名称： 云南农业大学学报(自然科学)

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2013 年 28 卷 02 期

页码： 163-168

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对采自云南元谋的花生丛枝植株总DNA进行secY基因的巢式PCR扩增,得到约1 700 bp的特异扩增片段,将该扩增产物克隆后进行序列测定,表明该片段长1 709 bp,该序列包括部分rpl15基因、全部secY基因序列以及部分的map基因,为植原体部分spc核糖体蛋白操纵子,其中secY基因编码的蛋白包括420个氨基酸,为含有10个明显跨膜区的整合性跨膜蛋白。通过同源性比对及构建的系统进化树,表明该株系与来源于台湾、海南的花生丛枝植原体亲缘关系最近,确定了该株系属于16SrII-A亚组成员。该分类结果与基于16SrDNA及rp基因的分析结果一致。

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