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野生大麻叶绿体基因组分子多态标记的筛选与开发

文献类型: 中文期刊

作者: 张庆滢 1 ; 陈璇 1 ; 郭孟璧 1 ; 郭蓉 1 ; 许艳萍 1 ; 杨明 1 ; 郭鸿彦 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院经济作物研究所

关键词: 野生大麻;叶绿体基因组;遗传多态性;分子标记

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2017 年 03 期

页码: 979-985

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以6份不同生态区野生大麻为试验材料,对叶绿体17个高变区的通用引物进行多态性筛选,同时基于已公布的大麻叶绿体基因组全序列,应用生物信息学软件对其进行比较基因组学分析,开发新的多态性引物。结果显示:(1)17对通用引物,通用性达76.5%,但仅ndh F-rpl32引物产物多态性好;(2)比较基因组学研究表明大麻叶绿体基因组多态性比较低,但存在极少的高变区,针对全序列高变区段设计的4对引物(trn L-rpl32~a,rps8-rps11,psa I-acc D,rps16~a)在6份野生大麻群体材料中分别有2~8个变异位点,具有较高的多态性。叶绿体非编码基因片段通用引物ndh F-rpl32及本研究针对大麻开发的trn L-rpl32~a、rps8-rps11、psa I-acc D、rps16~a引物在大麻中具有专一性强、产物多态性高等特点,可作为高效分子标记应用于大麻种质资源遗传多样性与保护、物种起源与遗传进化、种下分类鉴定、工业大麻育种等研究。

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