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云南芝麻丛枝和花变叶植原体16S rRNA和rp基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 苏帆 1 ; 杨子祥 2 ; 王柱华 1 ; 万琼莲 3 ; 何孟兰 1 ; 毛清源 1 ; 蔡红 1 ;

作者机构: 1.云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室

2.云南省农业科学院热区生态农业研究所

3.玉溪师范学院化学生物与环境学院

关键词: 芝麻;丛枝;花变叶;植原体;16S rRNA基因;rp基因

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2021 年 006 期

页码: 888-897

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究通过对表现出丛枝和花变叶症状的芝麻感病植株总DNA进行植原体16S rRNA和rp基因的PCR扩增、克隆、测序及序列分析,明确了两种病株的病原均为植原体,并将其命名为云南元谋芝麻丛枝植原体(SEWB-YNym)和云南元谋芝麻花变叶植原体(SEP-YNym)。两个株系的16S rRNA基因片段长度均为1 248 bp,并且碱基序列完全一致。通过与其他地区报道的芝麻植原体株系16S rRNA基因序列比对后发现这两个株系与来自缅甸的株系不存在位点差异,而与泰国、中国台湾、印度的株系分别存在3~6个位点差异。同时,还从两个株系中获得了长度均为1 171 bp并且碱基序列也完全一致的SEWB-YNym和SEP-YNym的rp基因序列。此rp基因序列包括全部rpl22基因(nt90-476)和部分rps3基因(nt550-1170),分别编码128和206个氨基酸。通过对16S rRNA和rp基因的序列进行同源性比对、构建系统进化树等分析,表明两个株系与候选种‘Candidatus Phytoplasma aurantifolia’相关,为16SrII-A亚组成员,并归属于植原体rp-iii亚进化支。

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