文献类型： 中文期刊

作者： 卢珍红 ¹ ; 莫锡君 ¹ ; 原晓龙 ² ; 李绅崇 ¹ ; 单芹丽 ¹ ; 王毅 ² ;

作者机构： 1.云南省农业科学院花卉研究所

2.云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

关键词： 非洲菊;叶绿体基因组;密码子偏好性;自然选择

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 021 期

页码： 7286-7293

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析非洲菊叶绿体基因组密码子使用模式，本研究从其叶绿体基因组中去除重复CDS(coding DNA sequence)和序列长度小于300 bp后得到53条基因序列，利用Codon W和在线程序CUSP分析其密码子偏好性。结果显示，非洲菊叶绿体基因组密码子第3位的GC含量为27.94%，偏向于以碱基A和U结尾；ENC范围为36.02～57.43，平均值为47.66,ENC值>45的基因有40条，密码子的偏性较弱；RSCU值>1.00的密码子有29个。中性绘图、ENC-plot及PR2-plot分析结果显示，自然选择是非洲菊叶绿体基因组密码子使用偏性的主要影响因素。最优密码子为UUG、CUU、AAU、AGA、GGA、UAU、CAU。本研究结果为非洲菊重要经济性状的遗传改良、叶绿体遗传和进化分析提供必要的基础数据。