文献类型： 中文期刊

作者： 张露 ¹ ; 李世峰 ² ; 宋杰 ² ; 解玮佳 ² ; 彭绿春 ² ; 李树发 ² ; 王继华 ³ ;

作者机构： 1.云南省农业科学院花卉研究所;国家观赏园艺工程技术研究中心;云南省花卉育种重点实验室

2.;云南省农业科学院花卉研究所;国家观赏园艺工程技术研究中心;云南省花卉育种重点实验室

3.;云南省农业科学院花卉研究所;国家观赏园艺工程技术研究中心;云南省花卉育种重点实验室;

关键词： 马缨杜鹃;基因组大小;杂合率;GC含量;重复序列

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 326-331

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究采用高通量测序技术(Illumina Hiseq ~(TM)2000)首次对世界名贵园林花卉马缨杜鹃(Rhododendron delavayi)进行了基因组大小的测定,并评估了马缨杜鹃的GC含量、杂合率和序列重复度等信息参数,为马缨杜鹃全基因组测序策略的选择提供了有据参考。全基因组扫描结果如下:马缨杜鹃的基因组大小约为698 Mb,杂合率较高约为1.25%,GC含量约为39%,且具有一定的基因组序列重复度。研究表明:马缨杜鹃的全基因组测序分析不宜采用全基因组鸟枪法(WGS),可尝试WGS与fosmid或BAC-to-BAC相结合的测序策略,亦或采用杂合组装软件进行序列拼装,以提高全基因组序列的拼装质量。