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云南元江普通野生稻cDNA文库注释

文献类型： 中文期刊

作者： 史冬燕 1 ; 程在全 2 ;

作者机构： 1.山东菏泽学院生物系

2.云南省农科院生物技术与种质资源研究所

关键词： 元江普通野生稻;cDNA文库;SMARTTM技术;序列同源性

期刊名称： 贵州大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-5269

年卷期： 2008 年 25 卷 02 期

页码： 217-220

摘要： 从元江普通野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择115个菌样进行测序,获得的序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等生物信息分析软件对这些序列进行分析,结果为:与栽培稻(Oryza sativa(japonica cultivar-group))序列比较匹配碱基数>400bp的占48.45%;确定可阅读框(>100bp,具有起始和终止密码子)的占70%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有38个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有17个、16个和24个。

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