您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

甘蔗MOC1基因(ScMOC1)的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李旭娟 1 ; 李纯佳 2 ; 徐超华 2 ; 刘洪博 2 ; 吴转娣 2 ; 林秀琴 2 ; 陆鑫 2 ; 毛钧 2 ; 字秋艳 2 ; 刘新龙 3 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室

2.;云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室

3.;云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室;

关键词: 甘蔗;分蘖;MOC1基因;序列变异分析;表达分析

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2017 年 04 期

页码: 734-746

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: MONOCULM 1(MOC1)基因在植物腋分生组织和腋芽的形成中发挥重要作用,是植物分蘖关键调控基因。本研究利用同源基因克隆法结合RT-PCR、RACE技术从甘蔗品种ROC22中克隆获得MOC1的同源基因,命名为Sc MOC1。生物信息学分析发现该基因的c DNA序列包含一个长度为1299 bp的开放阅读框,编码432个氨基酸残基组成的含有GRAS保守结构域的非分泌蛋白,其分子量为45.43 k D,理化等电点p I为6.98。序列比对分析显示Sc MOC1与高粱(Sorghum bicolor(L.)Moench)、赖草(Leymus secalinus(Georgi)Tzvel.)、水稻(Oryza sativa L.)等禾本科植物同源蛋白氨基酸序列一致性较高;系统进化树分析显示其与高粱、小米草(Setaria italica(L.)P.Beauv.)、玉米(Zea mays L.)等禾本科植物MOC1同源蛋白亲缘关系最近;Sc MOC1在甘蔗品种ROC22中的序列变异分析发现,30个克隆得到的序列中共有46个SNP位点和29处In Del位点,其中1个位点发生的单个碱基缺失和另一个位点的4个碱基插入是造成基因编码蛋白序列变化的主要原因。中性检测表明,Sc MOC1在ROC22中遵循中性进化模型。采用实时荧光定量PCR分析Sc MOC1在甘蔗品种ROC22分蘖期不同组织部位(根、茎、叶、分蘖芽、叶鞘、生长点)、茎尖生长点和不同发育阶段腋芽(幼嫩腋芽、半大腋芽、较大腋芽、成熟休眠腋芽)的表达特征,结果显示Sc MOC1在分蘖期的ROC22中的表达具有组织特异性,在生命活跃的茎尖生长点处表达量最高;在腋芽形成发育过程中该基因表达总体呈现出"升-降-升-降"的趋势,说明Sc MOC1基因可能在甘蔗腋芽形成发育阶段中发挥作用。以上研究可推测Sc MOC1在甘蔗的分蘖性状调控上扮演重要的角色。本研究为Sc MOC1的功能研究及其在甘蔗产量分子辅助育种中的利用奠定基础。

  • 相关文献

[1]甘蔗HD-Zip Ⅰ亚家族转录因子基因ScGT1的克隆和生物信息学分析. 李旭娟,李纯佳,林秀琴,刘洪博,徐超华,字秋艳,毛钧,陆鑫,刘新龙. 2019

[2]甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析. 李旭娟,林秀琴,刘洪博,李纯佳,徐超华,刘新龙. 2015

[3]甘蔗分蘖性状研究进展. 吕爱丽,吴才文,刘新龙,曾千春. 2016

[4]甘蔗TAD1(ScTAD1)的克隆与表达分析. 李旭娟,字秋艳,李纯佳,刘洪博,林秀琴,徐超华,陆鑫,毛钧,刘新龙. 2017

[5]超高产水稻适宜单株成穗数的定量计算. 李刚华,王绍华,杨从党,黄庆宇,李德安. 2008

[6]合系35x老来红联合世代耐低磷性状主基因加多基因遗传研究. 杜娟,曾亚文,杨树明,普晓英,杨涛,崔虹,王雨辰,罗曦. 2008

[7]合系35×老来红联合世代耐低磷性状主基因加多基因遗传研究. 杜娟,曾亚文,杨树明,普晓英,杨涛,崔虹,王雨辰,罗曦. 2008

[8]桑树EIN2基因的分离与表达. 刘长英,吕蕊花,朱攀攀,范伟,李军,王晓红,李镇刚,王茜龄,赵爱春. 2014

[9]滇龙胆草7-脱氧番木鳖酸-7-羟化酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王元忠. 2019

[10]滇龙胆甲羟戊酸激酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,赵静,杨娇,王元忠. 2015

[11]茶树冷诱导基因RAV的克隆与表达特性分析. 陈林波,李叶云,王琴,高永亮,江昌俊. 2010

[12]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022

[13]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021

[14]苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2023

[15]滇牡丹PdANR基因克隆及表达模式分析. 杜春,平怀磊,王文治,张平芳,张怀壁,王娟. 2022

[16]滇水金凤LWD基因的克隆及表达分析. 李新艺,李洋,罗超,魏春梅,黄美娟,瞿素萍,黄海泉. 2022

[17]西方蜜蜂Lozenge基因的克隆鉴定及时空表达分析. 黄蕾,朱雅楠,梁立强,李秋方,李正汉卿,林焱,聂红毅,苏松坤. 2023

[18]滇水金凤花斑形成相关基因IuMYB114和IuMYB36的克隆及表达分析. 陶宇蝶,孟丹晨,黄美娟,魏春梅,赵秋燕,周敏,瞿素萍,黄海泉. 2023

[19]滇龙胆香叶醇10-羟化酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,李爽,刘倩倩,王元忠,王家金. 2017

[20]紫娟茶树bHLH转录因子MYC1基因克隆及表达分析. 曲浩,刘悦,孙云南,尚卫琼,田易萍,陈林波. 2020

作者其他论文 更多>>