您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 向贵生 1 ; 张颢 1 ; 王其刚 1 ; 晏慧君 1 ; 周宁宁 1 ; 陈敏 1 ; 唐开学 1 ; 邱显钦 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院花卉研究所;云南大学生命科学学院;国家观赏园艺工程技术研究中心

关键词: 长尖叶蔷薇;大花香水月季;MLO基因;抗白粉病;生物信息学;q RT-PCR

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2018 年 04 期

页码: 769-779

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录组测序的基础上,利用生物信息学方法,从其转录组数据中共获得23条MLO unigenes并对其进行了分析。结果显示它们之间的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157~0.190,富含亮氨酸和丝氨酸。亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5~9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成。其中,等电点小于7的仅有1条,2条蛋白具有信号肽。这23条MLO蛋白具有15个长度在15~50个氨基酸间的保守基序。它们的系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季间具有较高的同源性和保守性。将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥的MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病的候选基因,对这6条候选基因进一步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因的典型结构特征。最后,通过q RT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因的相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势。上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌的互作过程。

  • 相关文献

[1]VIGS技术初步鉴定RgMLO6和RlMLO7基因对白粉病的负调控功能. 朱正锦,陈敏,田永贤,向贵生,张颢,邱显钦. 2023

[2]蔷薇科植物MLO蛋白家族的生物信息学分析. 向贵生,王开锦,晏慧君,李淑斌,周宁宁,唐开学,邱显钦. 2018

[3]植物抗白粉病MLO基因研究进展. 田永贤,陈敏,王其刚,张颢,邱显钦. 2020

[4]不同物种Mlo基因生物信息学分析. 陈玲,邱显钦,张颢,晏慧君,王其刚,唐开学. 2012

[5]云南长尖叶蔷薇自然居群遗传多样性分析. 邱显钦,唐开学,王其刚,蹇洪英,李树发,邵珠华,张颢. 2013

[6]大花香水月季再生体系的初步建立. 孟令宁,晏慧君,张颢,蹇洪英,周宁宁,唐开学. 2012

[7]云南大花香水月季居群遗传多样性的SSR分析. 邱显钦,唐开学,蹇洪英,王其刚,李树发,邵珠华,张颢. 2011

[8]大花香水月季的授粉率及花粉管生长途径. 王其刚,刘红明,晏慧君,蹇洪英,张颢,唐开学. 2012

[9]大花香水月季(Rosa odorata var. gigantea)茎段组织培养的抗褐化研究. 李纯佳,张颢,周宁宁,张婷,晏慧君,李淑斌,蹇洪英,唐开学. 2012

[10]野蔷薇(Rosa multiflora)抗白粉病基因RmMlo的克隆与表达分析. 邱显钦,包满珠,张颢,蹇洪英,王其刚,晏慧君,张婷,唐开学. 2011

[11]半无叶型豌豆新品种云豌35号的选育. 胡朝芹,吕梅媛,杨峰,于海天,杨新,王玉宝,王丽萍,郑爱清,代正明,唐永生,何玉华. 2022

[12]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016

[13]甘蔗HD-Zip Ⅰ亚家族转录因子基因ScGT1的克隆和生物信息学分析. 李旭娟,李纯佳,林秀琴,刘洪博,徐超华,字秋艳,毛钧,陆鑫,刘新龙. 2019

[14]番茄斑萎病毒属病毒非结构蛋白NSs的生物信息学分析. 郑宽瑜,董家红,苏晓霞,方琦,郑雪,张仲凯. 2014

[15]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018

[16]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018

[17]猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,唐宏涛,高林青,王世雄,杨云,浦仕飞,刘丽仙. 2018

[18]玫瑰与烟草间作对烟叶蛋白质影响的生物信息学分析. 徐洁,余萍,董超,朱海滨,张静,杨义,罗云,姚春馨,陶南. 2016

[19]蓖麻DNA甲基转移酶序列与基因表达分析. 代梦媛,高梅,郭丽芬,邓剑川,李文昌. 2016

[20]蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2020

作者其他论文 更多>>