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基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 向贵生 1 ; 张颢 1 ; 王其刚 1 ; 晏慧君 1 ; 周宁宁 1 ; 陈敏 1 ; 唐开学 1 ; 邱显钦 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院花卉研究所;云南大学生命科学学院;国家观赏园艺工程技术研究中心

关键词: 长尖叶蔷薇;大花香水月季;MLO基因;抗白粉病;生物信息学;q RT-PCR

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2018 年 04 期

页码: 769-779

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 在对长尖叶蔷薇和大花香水月季转录组测序的基础上,利用生物信息学方法,从其转录组数据中共获得23条MLO unigenes并对其进行了分析。结果显示它们之间的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,多数为疏水性蛋白,平均亲水系数为-0.157~0.190,富含亮氨酸和丝氨酸。亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5~9个跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋组成。其中,等电点小于7的仅有1条,2条蛋白具有信号肽。这23条MLO蛋白具有15个长度在15~50个氨基酸间的保守基序。它们的系统进化关系分析结果揭示了MLO基因在长尖叶蔷薇与大花香水月季间具有较高的同源性和保守性。将这23条unigenes与来自于月季和拟南芥的MLO基因进行聚类分析,确定了6条可能参与抗白粉病的候选基因,对这6条候选基因进一步分析发现仅有2条unigenes符合MLO型白粉病基因的典型结构特征。最后,通过q RT-PCR试验验证,结果表明:这2条候选基因的相对表达量,在受到白粉病菌侵染后呈积极上调趋势。上述研究结果表明这2条候选基因很可能参与了寄主—白粉病菌的互作过程。

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