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云南不同稻区稻瘟病菌群体遗传结构的SSR分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘树芳 1 ; 张先闻 1 ; 董丽英 1 ; 刘沛 1 ; 田维逵 2 ; 周伍民 1 ; 杨勤忠 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院农业环境资源研究所/云南省农业跨境有害生物绿色防控重点实验室

2.勐海县植保植检与土壤肥料工作站

关键词: 水稻;稻瘟病菌;SSR标记;遗传结构;宗谱

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2023 年 012 期

页码: 123-130

收录情况: CSCD

摘要: 为了解稻瘟病菌的群体遗传结构,选用13对SSR标记对2007—2013年分离自云南省陆稻区、籼稻区和粳稻区(共计13个州)的125个稻瘟病菌单孢菌株的全基因组DNA进行PCR扩增及分析,结果13对引物共检测出128个等位基因;聚类分析表明,在相似系数为0.57时,125个供试菌株可划分为29个遗传宗谱,优势宗谱YN02包含了39个菌株,占总菌株数的31.20%,次优势宗谱YN08包含了15个菌株,占总菌株数的12.00%,其余71个菌株分属27个宗谱;表明云南省既有优势宗谱,又有较多遗传多样性的小宗谱,菌株群体遗传多样性丰富;比较不同稻区菌株群体的宗谱频率发现,陆稻区菌株的宗谱频率为65.52%,粳稻区和籼稻区菌株的宗谱频率分别为27.59%和13.79%,表明陆稻区菌株群体的遗传结构比粳稻区、籼稻区菌株复杂。因此,针对菌株群体宗谱较少,且优势宗谱突出的地方,应加强品种多样化种植,有利于稻瘟病菌群体的稳定化选择,降低病害流行风险。

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