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基于系谱和SSR标记的高山杜鹃杂交种亲缘关系分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张露 1 ; 王继华 1 ; 解玮佳 1 ; 蔡艳飞 1 ; 宋杰 1 ; 彭绿春 1 ; 李树发 1 ; 李世峰 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院花卉研究所国家观赏园艺工程技术研究中心云南省花卉育种重点实验室

关键词: 高山杜鹃;DNA提取;SSR引物筛选;系谱;亲缘关系

期刊名称: 西北植物学报

ISSN: 1000-4025

年卷期: 2016 年 36 卷 12 期

页码: 2421-2432

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 该研究对高山杜鹃(Rhododendron L.)的总DNA提取方法进行了改良,然后综合利用高山杜鹃EST数据库和该实验室的马缨杜鹃高通量测序数据,引用已发表文献的SSR引物,从154对SSR引物中筛选出了26对多态性高、重复性好、条带清晰的SSR引物。再从中随机选择10对SSR引物进行荧光标记,对69份不同高山杜鹃的种质进行遗传多样性分析。结果表明,平均有效等位基因数6.959 2个;位点多态性信息含量(PIC)、观测杂合度(HO)、期望杂合度(HE)和Neis基因多样性(H)分别为0.795 2、0.543 5、0.826 5和0.820 2;杂交种间的非加权配对算术平均(UPGMA)聚类结果与其谱系分析结果基本一致,可实现对一些未知来源的育成品种资源进行祖先亲本类型的推测。

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