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西方蜜蜂囊状幼虫病病毒云南毒株的多聚蛋白基因扩增及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 曹兰 1 ; 沈克飞 1 ; 王瑞生 1 ; 张邑帆 1 ; 高丽娇 1 ; 张祖芸 2 ; 曹联飞 3 ;

作者机构: 1.重庆市畜牧科学院

2.云南省农业科学院

3.浙江省农业科学院

关键词: 蜜蜂;囊状幼虫病病毒;多聚蛋白基因;同源性;进化树

期刊名称: 中国生物制品学杂志

ISSN:

年卷期: 2021 年 006 期

页码: 688-693

收录情况: CSCD

摘要: 目的扩增云南地区西方蜜蜂(Apis mellifera)自然感染囊状幼虫病病毒(sacbrood virus,SBV)的多聚蛋白(polyprotein)基因,并进行序列分析。方法采用RT-PCR方法分别从云南3份感染SBV的西方蜜蜂幼虫样本中扩增SBV的多聚蛋白基因,进行序列测定、拼接、序列比对、基因重组及分子进化分析。结果通过序列拼接得到3条云南西方蜜蜂的SBV(AmSBV-YN)序列,占SBV基因组长度的97%,包含完整的多聚蛋白基因。3条AmSBV-YN序列间的同源性大于99%,与GenBank上已知SBV序列的同源性为91%~93%。AmSBV-YN与韩国西方蜜蜂的SBV(AmSBV-Kor)KP296800可能在5′端发生重组。多聚蛋白基因构建的进化树显示,AmSBV-YN单独构成云南基因型,在RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)基因进化树中显示,AmSBV-YN与其他感染中国西方蜜蜂的SBV(AmSBV-Chn)聚集成云南基因型。结论成功扩增出SBV云南毒株的多聚蛋白基AmSBV-YN,SBV具有丰富的遗传多样性,AmSBV-YN可能是感染我国西方蜜蜂SBV的代表株。

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