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不同物种Mlo基因生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈玲 1 ; 邱显钦 1 ; 张颢 1 ; 晏慧君 1 ; 王其刚 1 ; 唐开学 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院花卉研究所-花卉育种重点实验室

关键词： 白粉病;Mlo基因;多态性;生物信息学;分子系统发育

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2012 年 25 卷 04 期

页码： 1302-1308

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用比较基因组学和生物信息学方法,比较了从藻类到高等植物Mlo基因的CDS序列,并对该基因的遗传多样性、氨基酸功能结构及分子系统发育进行分析。结果表明,85条基因序列共检测到57个多态位点,生成70个单倍型。物种间及物种内Mlo基因存在丰富的遗传多态性;氨基酸结构域分析发现,20个物种含有一段特定的Mlo结构域,其中低等植物的跨膜螺旋区域(1～5)明显比高等植物的跨膜螺旋区域(6～8)少;分子系统进化树结果显示,不同物种的聚类情况与植物学分类系统基本一致。本研究为进一步探索Mlo基因的生物学功能和确定该基因作为分子标记提供了基础依据。

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