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云南疣粒野生稻部分cDNA片段的分离和注释

文献类型: 中文期刊

作者: 史冬燕 1 ; 程在全 2 ;

作者机构: 1.山东菏泽学院生物系

2.云南省农科院生物技术与种质资源研究所

关键词: 云南疣粒野生稻;cDNA文库;SMARTTM技术;序列同源性

期刊名称: 安徽大学学报(自然科学版)

ISSN: 1000-2162

年卷期: 2008 年 32 卷 03 期

页码: 89-92

收录情况: 北大核心

摘要: 从疣粒野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择120个菌样进行测序,获得的95条序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等软件进行序列分析,结果为:与栽培稻日本晴序列比较匹配碱基数>400 bp的占27.37%;确定可阅读框(>100 bp,具有起始和终止密码子)的占90%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有46个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有34个、31个和31个.

  • 相关文献

[1]云南元江普通野生稻cDNA文库注释. 史冬燕,程在全. 2008

[2]云南疣粒野生稻原生质体高效分离培养体系的建立. 陈越,王玲仙,付坚,陈玲,肖素勤,柯学,钟巧芳,赵才美,余腾琼,王波,张敦宇,殷富有,程在全. 2019

[3]元江普通野生稻叶片cDNA文库的构建及部分基因片段分析. 史冬燕,杨明挚,黄兴奇,陈善娜,程在全. 2008

[4]cDNA文库构建策略及其分析研究进展. 晏慧君,黄兴奇,程在全. 2006

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