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金银花DNA去甲基化酶基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 齐琳洁 1 ; 袁媛 2 ; 伍翀 2 ; 黄璐琦 2 ; 陈平 3 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院药用植物研究所

2.中国中医科学院中药研究所

3.武汉工业学院

关键词： 金银花;去甲基化酶基因;生物信息学分析

期刊名称： 药学学报

ISSN： 0513-4870

年卷期： 2015 年 03 期

页码： 367-371

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： DNA去甲基化酶基因广泛存在于植物中,本文主要通过生物信息学的方法从金银花转录组中获得4个DNA去甲基化酶基因,分别为LJDME1、LJDME2、LJDME3和LJDME4,并预测其编码蛋白的理化性质和表达模式。系统进化树结果表明LJDME1、LJDME2聚为一类,LJDME3、LJDME4聚为一类,与拟南芥中的DME关系更为密切。基因表达分析表明,4个DNA去甲基化酶基因在变种间差异表达明显,LJDME1、LJDME2基因表达水平在红金银花中高于金银花,推测其可能参与调控金银花活性成分积累的过程,并且4个DNA去甲基化酶基因具有组织表达特异性。本研究为进一步解析金银花中DNA去甲基化酶的功能奠定了基础。

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