文献类型： 中文期刊
作者：
李文凤
1
;
张志想
2
;
李世访
2
;
作者机构： 1.云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室
2.中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室
关键词： 甘蔗线条花叶病毒;HC-Pro基因;分子变异
期刊名称： 植物保护
ISSN： 0529-1542
年卷期： 2017 年 43 卷 02 期
页码： 29-36
收录情况： 北大核心
摘要： 为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus(SCSMV)不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律,本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列,通过生物信息学分析,分别从重组、系统发生、选择压力等方面研究SCSMV HC-Pro基因的分子变异特征。共测定了44条SCSMV HC-Pro基因序列,相似性最低值为70%;HC-Pro基因重组频率较低,仅发现3个重组位点,其中一个系首次报道;与先前报道相比,部分新测定云南蔗区的SCSMV分离物在HC-Pro基因上形成一个新组-第Ⅲ组;HC-Pro基因处于很强的负选择压力作用,未发现正向选择作用位点。本研究结果进一步证明SCSMV HC-Pro基因具有高度的遗传多样性。
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