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甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李旭娟 1 ; 刘洪博 1 ; 林秀琴 1 ; 吴转娣 1 ; 徐超华 1 ; 刘新龙 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室

关键词： 甘蔗;KNOX基因;电子克隆;生物信息学分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2015 年 4 卷 01 期

页码： 136-142

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1,Oskn1)为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明:该基因包含一个1 071 bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,分子量为39.36 kD,理论等电点为6.47。该基因很可能定位于细胞核,起转录调控作用,序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等KN1蛋白高度相似。以上分析结果为进一步研究Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。

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