文献类型： 中文期刊
作者： 李文凤 1 ; 李世访 2 ;
作者机构： 1.云南省农业科学院甘蔗研究所
2.中国农业科学院植物保护研究所
关键词： 甘蔗线条花叶病毒;NIa基因;系统发生
期刊名称： 微生物学报
ISSN： 0001-6209
年卷期： 2016 年 56 卷 11 期
页码： 1802-1810
收录情况： 北大核心
摘要： 【目的】利用NIa基因,阐明甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的种系发生关系,为预测SCSMV流行变异趋势及科学防控提供理论依据。【方法】从云南蔗区和国家甘蔗种质资源圃采集感病样品,RT-PCR扩增获得SCSMV NIa基因序列后,使用Splits Tree、RDP、Phy ML、Dna SP等软件分析SCSMV中国分离物的系统发生、选择压力及基因流动等特征。【结果】共获得23条SCSMV NIa基因序列。这些序列间未发生重组,云南蔗区的部分序列形成1个新簇,且云南蔗区与国家甘蔗种质资源圃之间的基因交流不显著。此外,选择压力分析表明,NIa基因受很强的负选择压力作用。【结论】与P1、HC-Pro和CP等基因类似,SCSMV在NIa基因上也包含5个簇;SCSMV云南分离物具有较高的遗传多样性和清晰的地理相关性。
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