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云南蔗区甘蔗线条花叶病毒分离物NIa基因形成新簇

文献类型： 中文期刊

作者： 李文凤 1 ; 李世访 2 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院甘蔗研究所

2.中国农业科学院植物保护研究所

关键词： 甘蔗线条花叶病毒;NIa基因;系统发生

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2016 年 56 卷 11 期

页码： 1802-1810

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】利用NIa基因,阐明甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的种系发生关系,为预测SCSMV流行变异趋势及科学防控提供理论依据。【方法】从云南蔗区和国家甘蔗种质资源圃采集感病样品,RT-PCR扩增获得SCSMV NIa基因序列后,使用Splits Tree、RDP、Phy ML、Dna SP等软件分析SCSMV中国分离物的系统发生、选择压力及基因流动等特征。【结果】共获得23条SCSMV NIa基因序列。这些序列间未发生重组,云南蔗区的部分序列形成1个新簇,且云南蔗区与国家甘蔗种质资源圃之间的基因交流不显著。此外,选择压力分析表明,NIa基因受很强的负选择压力作用。【结论】与P1、HC-Pro和CP等基因类似,SCSMV在NIa基因上也包含5个簇;SCSMV云南分离物具有较高的遗传多样性和清晰的地理相关性。

  • 相关文献

[1]甘蔗线条花叶病毒HC-Pro基因的分子变异分析. 李文凤,张志想,李世访. 2017

[2]我国新育成甘蔗品种(系)对甘蔗线条花叶病毒和高粱花叶病毒的抗性评价. 李文凤,单红丽,张荣跃,王晓燕,罗志明,尹炯,仓晓燕,李婕,黄应昆. 2018

[3]家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析. 柴春利,代方银,潘敏慧,杜周和,胡海,鲁成. 2010

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