文献类型: 中文期刊
作者: 苏群 1 ; 田敏 2 ; 李春牛 1 ; 李先民 1 ; 卢家仕 1 ; 黄展文 1 ; 李杰梅 1 ; 卜朝阳 1 ; 王虹妍 1 ;
作者机构: 1.广西农业科学院花卉研究所
2.云南省农业科学院花卉研究所/国家观赏园艺工程技术研究中心
关键词: 睡莲;叶片胎生;转录组分析;差异表达基因;代谢通路
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2021 年 012 期
页码: 3443-3450
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 睡莲叶片胎生现象是繁育途径的重要补充,对种群的传播、扩散和生态环境的适应性有重要作用。通过转录组测序技术筛选和分析睡莲叶片胎生现象相关的代谢路径和调控基因,为深入认识睡莲叶片胎生发育的分子机制提供参考。以叶片具有胎生现象的‘小花睡莲’(X)和叶片无胎生现象的‘蓝星睡莲’(L)为材料,利用RNA-Seq技术对叶片4个发育阶段的叶脐部分进行生物信息学分析。分析对照(L)和样品(X)叶片不同发育阶段测序结果:筛选出的差异表达基因(DEGs)中,34 909个基因(48.65%)表达上调,36 850个基因(51.35%)表达下调。DEGs分析显示,随着叶片的发育,X和L上调基因和下调基因数均呈增加趋势。对L1-vs-X1、L4-vs-X4阶段的GO和KEGG功能富集分析表明,DEGs主要富集在质膜和膜相关成分、胞外区域、细胞壁等相关的细胞组分中,涉及到代谢过程、生物合成和应急响应等;Pathway代谢通路表明,DEGs主要参与到植物激素信号转导、苯丙烷类生物合成、氨基酸类代谢、类黄酮生物合成、甘油磷脂类代谢以及细胞周期相关等过程。对DEGs进一步分析,克隆出了4个可能参与睡莲叶片胎生发育的转录因子。
- 相关文献
[1]云南引进睡莲品种的性状评价及优良切花品种筛选. 田敏,苏群,刘霞,王鸿玮,李林梅,李绅崇,赵培飞. 2020
[2]睡莲新品种‘粉黛’. 苏群,田敏,王虹妍,毛立彦,卢家仕,唐毓玮,张进忠,杨亚涵,李先民,卜朝阳. 2019
[3]睡莲新品种‘红粉佳人’. 苏群,卢家仕,田敏,王虹妍,李先民,毛立彦,唐毓玮,杨亚涵,张进忠,卜朝阳. 2019
[4]云南水生花卉资源及其产业现状. 田敏,黎霞,苏群,瞿素萍,李绅崇,赵培飞. 2019
[5]基于生物信息学的睡莲SSR位点特征分析. 苏群,田敏,刘俊,王凌云,李春牛,李先民,黄展文,王虹妍. 2021
[6]桂南地区芳香型睡莲切花优良品种筛选. 杨亚涵,苏群,田敏,潘介春,毛立彦,唐毓玮,卜朝阳,卢家仕. 2019
[7]余甘子转录组分析. 赵琼玲,张永辉,罗会英,金杰,何璐,瞿文林,宋子波,沙毓沧. 2018
[8]卷叶木薯及其突变体叶片的比较转录组分析. 肖明昆,严炜,宋记明,张林辉,刘倩,段春芳,李月仙,姜太玲,沈绍斌,周迎春,沈正松,熊贤坤,罗鑫,白丽娜,刘光华. 2024
[9]大蜡螟触角转录组及嗅觉相关基因分析. 杨爽,赵慧婷,徐凯,郭丽娜,杜亚丽,李新宇,苏文婷,冯宇佳,龙登隆,姜玉锁. 2019
[10]水稻Epagri108铁毒胁迫条件下表达谱芯片数据分析. 刘慰华,寇姝燕,吴志刚,崔永祯,朱振华,袁平荣. 2021
[11]蒜芥茄响应大丽轮枝菌侵染的内源激素含量变化及其相关基因的表达分析. 蔚亚楠,尹梦莹,龚亚菊,黎志彬,鲍锐,杜光辉,桂敏,吴丽艳. 2022
[12]转录组测序分析外源水杨酸诱导茶树热激蛋白基因的响应. 刘悦,曲浩,田易萍,陈春林,冉隆珣,陈林波. 2024
[13]紫娟茶树叶片不同发育期花青素积累及合成相关基因的表达. 蒋会兵,孙云南,李梅,戴伟东,宋维希,田易萍,夏丽飞,陈林波. 2018
[14]两个柠檬品种叶片离区响应乙烯利处理的转录组分析. 董美超,尹拓,周东果,张汉尧,杨帆,王绍华,龙春瑞,付小猛,刘红明,郭莉娜,李丹萍,高俊燕. 2024
[15]特异茶树品种“紫娟”叶色转变的基因表达差异分析. 陈林波,夏丽飞,孙云南,梁名志,张正竹,李叶云,宛晓春. 2012
[16]基于数字基因表达谱分析的茶树花不育基因挖掘. 陈林波,夏丽飞,田易萍,李梅,宋维希,梁名志,江昌俊. 2017
[17]西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析. 宋文菲,胡宗文,苗春辉,余玉生,杨爽,李亚辉. 2022
[18]干旱胁迫下割手密根系转录组差异表达分析. 刘洪博,刘新龙,苏火生,陆鑫,徐超华,毛钧,林秀琴,李纯佳,李旭娟,字秋艳. 2017
作者其他论文 更多>>
-
纳米材料技术在香石竹切花保鲜中的应用研究进展
作者:田敏;施自明;蔡艳飞;孙丹;赵培飞
关键词:纳米材料;香石竹;保鲜;金属纳米;碳纳米;环糊精纳米海绵;氢纳米气泡水
-
睡莲属62个栽培种花朵挥发性成分GC-MS分析
作者:苏群;田敏;王虹妍;王凌云;刘俊;赵培飞;卜朝阳
关键词:睡莲属;花朵;挥发性成分;花香成分;气相色谱-质谱法;聚类分析
-
不同基质配比及营养配方对天竺葵·矾根·草莓生长和观赏性的影响
作者:邹凌;阳纯艳;赵培飞;田敏;施自明;王心潮;陆琳;苏艳
关键词:天竺葵;矾根;草莓;栽培基质;生长;观赏性
-
基于生物信息学的睡莲SSR位点特征分析
作者:苏群;田敏;刘俊;王凌云;李春牛;李先民;黄展文;王虹妍
关键词:睡莲;转录组;基因组;SSR特征;分子标记
-
六种太空莲挥发性成分分析
作者:田敏;王凌云;曹桦;李涵;陆琳;施自明;赵培飞
关键词:太空莲;太空育种;挥发性成分;气相色谱-质谱联用仪
-
热带睡莲新品种'蓝紫妃'的选育
作者:王虹妍;苏群;田敏;卜朝阳;李先民;卢家仕
关键词:睡莲属;实生选育;新品种
-
云南引进睡莲品种的性状评价及优良切花品种筛选
作者:田敏;苏群;刘霞;王鸿玮;李林梅;李绅崇;赵培飞
关键词:云南;睡莲;切花;性状评价;品种筛选