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基于EST—SSR的西南茶区茶树资源遗传多样性和亲缘关系分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘振 1 ; 王新超 1 ; 赵丽萍 1 ; 姚明哲 1 ; 王平盛 2 ; 许玫 2 ; 唐一春 2 ; 陈亮 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心

2.云南省农业科学院茶叶研究所

关键词: 茶树;EST-SSR遗传多样性;亲缘关系

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2008 年 6 卷 1 期

页码: 100-110

收录情况: CSCD

摘要: 利用本实验室cDNA文库测序所获得的茶树EST序列为主自行开发的24对和他人7对共31对EST-SSR引物,对60份西南茶区茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明,西南茶区茶树资源的遗传多样性非常丰富。31对引物共检测到等位位点137个,每个引物为2~8个之间,平均4.42个。遗传多态性信息含量(PIC)在0.09-0.85之间,平均达0.63。观测杂合度(H_o)在0.07-0.94之间,平均值为0.53。UPGMA聚类表明,按相似系数为0.39可将参试的60份种质资源分为五大类。聚类结果在分子水平上显示了我国西南茶区种质资源间的亲缘关系,为以后种质资源保存和新品种选育提供一定的启示。

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