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云南马铃薯A病毒分布及其外壳蛋白分子变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王东 1 ; 张磊 2 ; 董家红 2 ; 张仲凯 2 ;

作者机构： 1.云南农业大学植物保护学院

2.云南省农业生物技术重点实验室

关键词： 马铃薯A病毒;分布;外壳蛋白;系统进化;变异

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2012 年 25 卷 02 期

页码： 525-530

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究云南马铃薯A病毒(PVA)分布及其外壳蛋白的分子变异,2007年至2011年分别从云南滇西北、滇东北、滇中及滇南马铃薯种植区采集381份马铃薯样品,进行马铃薯A病毒DAS-ELISA检测,结果表明,PVA阳性样品共43份,其中滇西北22份,滇中17份,滇东北4份,滇南未检出。对带有PVA的部分样品进行电镜负染色观察,电镜下观察到长约750 nm、直径约15 nm的线状粒子。根据已报道的PVA外壳蛋白基因(cp基因)序列设计合成特异性引物,以带毒样品总RNA为模板,RT-PCR扩增得到807 bp目的片段,克隆测序并对其推导的外壳蛋白(CP)氨基酸序列进行同源性分析,并比较分析了不同地区PVA分离物CP氨基酸序列分子变异。结果表明,云南不同地区PVA分离物与GenBank中登录的部分PVA分离物CP氨基酸序列同源性为93.3%～100%,依据不同PVA分离物CP氨基酸序列构建系统进化树,云南PVA分离物与中国福建分离物(AF483279)亲缘关系较近,形成一个进化簇。PVA不同分离物CP氨基酸序列分子变异分析表明,不同分离物CP氨基酸变异位点主要分布在氨基酸序列的N端。

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