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云南大花蕙兰复合感染的ORSV和CyCMV病毒基因组序列特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 金晓香 1 ; 姚俊汐 1 ; 尹跃艳 2 ; 李婷婷 3 ; 郭淼 2 ; 钟静 3 ; 和寿星 2 ; 陈越 3 ; 和家卫 2 ; 鄢波 1 ; 丁铭 3 ;

作者机构: 1.西南林业大学园林园艺学院

2.云南省农业科学院高山经济植物研究所

3.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

关键词: 大花蕙兰;齿兰环斑病毒;建兰褪绿花叶病毒;基因组序列特征;复合侵染

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2024 年 008 期

页码: 1844-1852

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从云南丽江采集了40个大花蕙兰(Cymbidium hybridum)感病样品,利用高通量转录组测序对其中的病毒种类进行分析,Blastn N比对发现样品中存在建兰花叶病毒(cymbidium mosaic virus,Cym MV)、齿兰环斑病毒(odontoglossum ringspot virus,ORSV)和建兰褪绿花叶病毒(cymbidium chlorotic mosaic virus,Cy CMV)。利用RT-PCR对样品中病毒分离物的CP序列进行扩增,10份样品为ORSV和Cy CMV复合侵染。为进一步明确ORSV和Cy CMV云南分离物(ORSV-DH和Cy CMV-DH)的序列特征,分别对其全基因组序列进行了扩增及克隆,结果表明:ORSV-DH基因组全长序列为6 611 nt(Accession No.OP644547),Cy CMV-DH基因组全长序列为4 083 nt(Accession NO.OP629812),将ORSV-DH和Cy CMV-DH分别与已报道的分离物的全基因组序列进行核苷酸序列分析,发现ORSV-DH与其他分离物的核苷酸相似性为97.69%~99.41%,Cy CMV-DH为89.84%~98.19%。根据病毒全基因组核苷酸序列分别构建了ORSV-DH和Cy CMV-DH与本属其他分离物的系统进化树,明确了其分别与日本分离物ORSV-Cy-1(S83257)、Cy CMV-Japan(NC_027123)亲缘关系最近。

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