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从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张永红 1 ; 唐芬芬 1 ; 邵榆岚 1 ; 朱峰 1 ; 白兴荣 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所

关键词： 家蚕质型多角体病毒;分离株;基因组片段;系统进化;RNA聚合酶基因;多角体蛋白基因

期刊名称： 蚕业科学

ISSN： 0257-4799

年卷期： 2015 年 41 卷 06 期

页码： 1036-1043

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 家蚕质型多角体病毒(BmCPV)是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条dsRNA序列(S1~S10)并提交至NCBI数据库中。序列分析表明该病毒基因组序列全长24810bp,S1~S10片段序列都具有完整的ORF。BLAST比对发现克隆的该病毒基因组各片段编码区序列与已报道的1型BmCPV片段的相似度达88%以上,氨基酸序列相似度达90%以上;10条dsRNA基因组片段末端均有保守帽子结构5'-AGUAA……GUUAGCC-3'。基于S2片段RdRp基因的系统进化分析发现,该病毒与其他3个1型BmCPV分离株BmCPV1-Suzhou、BmCPV1-China、BmCPV1-Ⅰ聚为一支,基于S10片段polh基因的系统进化分析也表明该病毒为1型BmCPV新的分离株系。根据上述研究结果将该病毒定名为BmCPV1-Yunnan。

  • 相关文献

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[4]云南省区收集琥珀蚕的mtDNA COⅠ基因克隆和系统进化分析. 钟健,江秀均,陈安利,唐芬芬,邵榆岚,柴建萍,白兴荣. 2014

[5]水稻稻瘟病菌基因组中疏水蛋白的分布与聚类分析. 吴毅歆,范成明,何月秋. 2009

[6]普通野生稻在稻属中的分类进化及资源研究. 柯学,陈越,殷富有,钟巧芳,Ghidan Walid,阚东扬,黄兴奇,程在全. 2018

[7]蔷薇科植物MLO蛋白家族的生物信息学分析. 向贵生,王开锦,晏慧君,李淑斌,周宁宁,唐开学,邱显钦. 2018

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