文献类型： 中文期刊
作者： 蒋春苗 1 ; 程在全 1 ; 孙正文 1 ; 李定琴 1 ; 余腾琼 2 ;
作者机构： 1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
2.云南省农业科学院农作物品种资源站
关键词： 云南普通野生稻;白叶枯病菌;抑制差减杂交;生物信息学分析;半定量RT-PCR;白叶枯病抗性基因
期刊名称： 中国科学:生命科学
ISSN： 1674-7232
年卷期： 2013 年 43 卷 11 期
页码： 972-980
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 以云南普通野生稻为材料,利用抑制差减杂交技术(SSH),构建了白叶枯病菌胁迫的云南普通野生稻特异表达基因的差减文库.通过对文库所有阳性单克隆进行测序,聚类分析后共获得494条高质量的表达序列标签(EST).经过BlastN分析,有417条与已知功能的序列有较高同源性;经BlastX分析,有104条EST与未知功能蛋白或假定蛋白有较高相似性,49条EST未能找到同源匹配,341条EST与已知功能蛋白有较高同源性.初步分析发现,这些基因主要涉及能量代谢、蛋白质代谢、核酸代谢、防御与抗逆应答反应、信号转导、光合作用及膜运输等代谢过程.使用半定量RT-PCR研究了7个可能与白叶枯病抗性相关的EST序列在云南普通野生稻对照和白叶枯病菌处理的叶片中的表达情况,并获得这些基因的表达谱.结果发现,克隆编号为OR7,OR68和OR826的EST受白叶枯病菌胁迫诱导上调表达,其中OR826 EST在蛋白数据库中无同源序列,可能是一类新的白叶枯病抗性基因,而组成型表达的OR143 EST在对照和接菌处理的叶片中均能检测到其mRNA的表达,但其表达量在白叶枯病菌胁迫48 h后逐渐增强,推测这些基因直接参与了云南普通野生稻抗病防御反应.本研究为从云南普通野生稻中发掘和克隆新的白叶枯病抗性基因提供了理论依据,为进一步研究云南普通野生稻抗白叶枯病的分子机制奠定了基础.
- 相关文献
[1]云南滇西高原粳稻区白叶枯病菌遗传多样性初探. 梁斌,王敬文,明风,戴陆园,叶鸣明,沈大棱. 2003
[2]云南稻毫梅抗白叶枯病新基因定位. 戴陆园,张端品,谢岳峰,陈勇. 1990
[3]云南高原粳稻白叶枯病菌的抗药性室内鉴定及其rpfC基因序列分析. 杨雅云,张恩来,阿新祥,汤翠凤,张斐斐,陈丹,董超,吴坤,徐福荣,周英,祁春学,戴陆园. 2014
[4]云南滇西北高原粳稻区白叶枯病菌致病型鉴定及分布. 彭新禧,余腾琼,李俊,杨雅云,和建平,李锦玲,徐福荣,戴陆园. 2011
[5]白叶枯病菌胞内蛋白的提取及电泳分离方法的构建. 于海天,阿新祥,刘自单,张恩来,汤翠凤. 2015
[6]云南高原粳稻区白叶枯病菌致病型鉴定及主栽品种抗性反应初析. 余腾琼,梁斌,叶昌荣,徐福荣,汤翠凤,毛孝强,戴陆园. 2005
[7]三套鉴别品种对云南高原粳稻白叶枯病菌致病型的鉴定比较. 胡意良,Yu Tengqiong,余腾琼,汤翠凤,阿新祥,彭新禧,戴陆园. 2009
[8]疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因ME281半定量RT-PCR分析. 吕广磊,付坚,和志娇,白现广,蔺忠龙,黄兴奇,杨和生,程在全. 2008
[9]疣粒野生稻抗白叶枯病相关基因ME196半定量RT-PCR分析. 吕广磊,刘芳芳,蔺忠龙,白现广,付坚,黄兴奇,程在全. 2009
[10]木香花抗黑斑病基因RbRdr1的克隆与表达分析. 范元兰,张真建,陈宇春,蹇洪英,晏慧君,张颢,周宁宁,王其刚,邱显钦. 2020
[11]中华蜜蜂气味受体基因AcerOR113的克隆与时空表达分析. 杜亚丽,王树杰,赵慧婷,潘建芳,杨爽,郭丽娜,徐凯,姜玉锁. 2017
[12]滇龙胆环烯醚萜氧化酶基因及启动子的克隆与生物信息学分析. 张晓东,李彩霞,赵青蓉,王元忠. 2018
[13]紫娟茶树miR828a靶基因WER的克隆及生物信息学分析. 刘悦,曲浩,尚卫琼,孙云南,田易萍,仝佳音,陈林波. 2020
[14]苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析. 尹桂芳,段迎,杨晓琳,蔡苏云,王艳青,卢文洁,孙道旺,贺润丽,王莉花. 2022
[15]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021
[16]家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析. 柴春利,代方银,潘敏慧,杜周和,胡海,鲁成. 2010
[17]百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析. 王浩,孙亮,张济民,贾文杰,吴雅文,张小平,李想,王有国. 2022
[18]甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息学分析. 吕爱丽,李旭娟,刘洪博,吴才文,曾千春,刘新龙. 2016
[19]滇龙胆乙酰CoA转移酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王连春,王元忠. 2016
[20]甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析. 李旭娟,林秀琴,刘洪博,李纯佳,徐超华,刘新龙. 2015
作者其他论文 更多>>
-
137份云南省地方稻抗白叶枯病多菌系多基因鉴定
作者：李玉琢;陈玲;张敦宇;管娟;张云;钟巧芳;殷富有;李馨;杨顺发;王波;程在全;罗琼;肖素勤
关键词：云南地方稻;白叶枯病;表型鉴定;基因分析;广谱抗病
-
药用野生稻拮抗稻瘟病内生细菌的筛选、鉴定及发酵条件优化
作者：雷凌云;钟巧芳;熊子璇;杨得正;刘丽;殷富有;陈玲;程在全;肖素勤
关键词：药用野生稻;稻瘟病;生物防治;内生菌
-
元江普通野生稻中抗白叶枯病基因鉴定与分析
作者：卢源达;钟巧芳;王波;张敦宇;殷富有;王玲仙;程在全;陈玲
关键词：元江普通野生稻;渗入系;白叶枯病;抗性基因
-
不同禾本科作物中ZmWRKY79同源基因的鉴定与分析
作者：卢源达;陈玲;杜云龙;刘学思;柯学;赵建屛;吴洪钦;刘鑫;李玉琢;朱文强;邢世军;程在全;钟巧芳
关键词：玉米;ZmWRKY79;同源基因;生物信息学
-
云南省4个州(市)疣粒野生稻的调查、收集与保护
作者：刘学思;殷富有;张敦宇;熊子璇;刘鑫;李玉琢;李俊;杨顺发;杨和生;白成星;彭钰婷;刘丽;钟巧芳;程在全;肖素勤
关键词：云南;疣粒野生稻;野生稻资源;分布现状;调查;收集;保护
-
基于CRISPR/Cas9的精准基因编辑技术研究进展
作者：薛珊;王淑雅;刘丽;钟巧芳;程在全;肖素勤
关键词：CRISPR/Cas9;单碱基编辑系统;引导编辑系统;双碱基编辑系统;转座子编辑系统
-
云南粳型地方稻资源抗稻瘟病鉴定评价
作者：管娟;肖素勤;陈玲;张敦宇;张云;程在全
关键词：水稻;稻瘟病;表型鉴定;基因分析;云南省
