文献类型： 中文期刊
作者： 李旭娟 1 ; 李纯佳 1 ; 林秀琴 1 ; 刘洪博 1 ; 徐超华 1 ; 字秋艳 1 ; 毛钧 1 ; 陆鑫 1 ; 刘新龙 1 ;
作者机构： 1.云南省农业科学院甘蔗研究所
关键词： 甘蔗;HD-Zip Ⅰ;ScGT1;分蘖;基因克隆;生物信息学
期刊名称： 中国糖料
ISSN： 1007-2624
年卷期： 2019 年 41 卷 001 期
页码： 1-7
摘要： Grassy Tiller1 (GT1)属于植物HD-Zip Ⅰ亚家族转录因子,通过抑制侧芽萌动和侧枝伸长调控植物分蘖性状.本研究使用RT-PCR和RACE技术从甘蔗品种ROC22中克隆出甘蔗GT1同源基因ScGT1 (MK318528).生物信息学分析发现该基因cDNA序列包含一个长度为723 bp的开放阅读框,可编码一个含240个氨基酸的蛋白.该蛋白具有一个Homeodomain保守结构域,分子量为26.44kD,理化等电点pI为6.04,属于亲水蛋白,无跨膜结构,不存在信号肽,可能定位于细胞核,参与氨基酸生物合成的可能性较高.蛋白结构及同源性分析表明该蛋白空间结构与高粱和玉米较为相似,Homeodomain结构域高度保守,变异较少.系统发育树分析表明该蛋白属于HD-Zip Ⅰ亚家族中的gt1 Clade类群,与高粱和玉米GT1亲缘关系较近,初步推测ScGT1可能通过腋芽分生组织发育的调控来影响分蘖表现.该研究可为后续该基因更深入的功能鉴定和分子辅助育种奠定重要的前期基础.
- 相关文献
[1]甘蔗MOC1基因(ScMOC1)的克隆与表达分析. 李旭娟,李纯佳,徐超华,刘洪博,吴转娣,林秀琴,陆鑫,毛钧,字秋艳,刘新龙. 2017
[2]甘蔗分蘖性状研究进展. 吕爱丽,吴才文,刘新龙,曾千春. 2016
[3]甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析. 李旭娟,林秀琴,刘洪博,李纯佳,徐超华,刘新龙. 2015
[4]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016
[5]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022
[6]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018
[7]云南特有火把梨UFGT基因片段的克隆与序列分析. 孟富宣,周军,王大玮,陶磅,董娇,徐世宏,段淋渊. 2016
[8]苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2023
[9]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018
[10]甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析. 吴转娣,刘新龙,刘家勇,昝逢刚,李旭娟,刘洪博,林秀琴,陈学宽,苏火生,赵培方,吴才文. 2017
[11]甘蔗ScF-box基因cDNA全长克隆和生物信息学分析. 吕爱丽,刘洪博,李旭娟,吴才文,刘新龙,曾千春. 2017
[12]合系35×老来红联合世代耐低磷性状主基因加多基因遗传研究. 杜娟,曾亚文,杨树明,普晓英,杨涛,崔虹,王雨辰,罗曦. 2008
[13]超高产水稻适宜单株成穗数的定量计算. 李刚华,王绍华,杨从党,黄庆宇,李德安. 2008
[14]合系35x老来红联合世代耐低磷性状主基因加多基因遗传研究. 杜娟,曾亚文,杨树明,普晓英,杨涛,崔虹,王雨辰,罗曦. 2008
[15]蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2020
[16]植物抗白粉病MLO基因研究进展. 田永贤,陈敏,王其刚,张颢,邱显钦. 2020
[17]猪睾丸表达序列37(TEX37)克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,王世雄,王荣琼,刘丽仙,霍金龙. 2020
[18]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021
[19]基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析. 向贵生,张颢,王其刚,晏慧君,周宁宁,陈敏,唐开学,邱显钦. 2018
[20]猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,唐宏涛,高林青,王世雄,杨云,浦仕飞,刘丽仙. 2018
作者其他论文 更多>>
-
甘蔗属种及其近缘属种蔗茅的全基因组密码子偏好性分析
作者：田春艳;李旭娟;李纯佳;毛钧;刘新龙
关键词：甘蔗属;蔗茅;基因组;密码子使用偏好性;最优密码子
-
基因组原位杂交技术在甘蔗研究中的应用
作者：张静;刘家勇;经艳芬;林秀琴
关键词：基因组原位杂交;甘蔗;遗传育种
-
美国引进甘蔗热带种的ARMS PCR真实性鉴定
作者：李旭娟;毛钧;赵培方;刘洪博;王晓燕;陆鑫
关键词：甘蔗热带种;ARMS PCR;真实性;鉴定;甘蔗育种
-
基于APSIM模型的低纬高原蔗区甘蔗生产潜力
作者：张跃彬;毛钧;李如丹;刀静梅;余凌翔;王靖
关键词：作物;模型;灌溉;气候;产量;蔗糖分
-
贵州省黔西南州甘蔗野生种质资源考察收集与表型性状初步研究
作者：徐超华;刘洪博;覃伟;毛钧;林秀琴;陆鑫
关键词：甘蔗;黔西南州;种质资源;表型性状;遗传多样性
-
5个甘蔗新品系叶绿素荧光参数的比较
作者：俞华先;安汝东;刘家勇;董立华;桃联安;经艳芬;刘洪博
关键词：甘蔗品系;叶绿素荧光参数;隶属函数法;主成分分析
-
不同刈割期甘蔗营养成分和生物产量研究及饲用价值评价
作者：李孟周;王智能;陆鑫;陈浩文;李登宇;范源洪
关键词：甘蔗;牧草;营养成分;主成分分析;综合评价
